risikofaktorer for Streptococcus suis-infektion: en systematisk gennemgang og metaanalyse
Studievalg
i alt 4.999 artikler blev identificeret i de indledende søgninger fra otte databaser (n = 4.997) og andre kilder (n = 2). Der var 682 poster tilbage efter fjernelse af duplikater, hvor 636 citater, der var procedurer eller ikke indeholdt risikofaktorer, blev udelukket ved titel og abstrakt screening. Der var 32 artikler inkluderet i systematisk gennemgang5,9,10,11,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40 og 3 case-control studies 19, 37, 38 I meta-analysen efter fuld tekstevaluering. PRISMA-rutediagrammet, der beskriver undersøgelsesudvælgelsesprocessen, blev vist i Fig. 1.
studiekarakteristika
de vigtigste studiekarakteristika blev vist i supplerende appendikstabel S1. Inkluderede undersøgelser med forskellige undersøgelsesdesign blev udført i 9 karakteristiske lande. Blandt disse var der 1 randomiseret dobbeltblind, placebokontrolleret forsøg10, 3 case-control-undersøgelser, hvor der var 1 matchet case-control37, 1 retrospektiv case-control38 og 1 prospektiv case-control-undersøgelser19, 28 beskrivende undersøgelser,herunder 3 folkesundhedsovervågningsundersøgelser27,40, 41,2 udbrudsundersøgelser 36, 39 og 1 epidemiologisk analyse i Kina23, en befolkningsbaseret undersøgelse af en fødevaresikkerhedskampagne30 og en retrospektiv kohorte, der identificerer risikofaktor for S. suis mortality34, 3 retrospektive anmeldelser16, 20, 21 og 17 sagsrapporter eller sagsserier9,11,13,14,15,17,18,22,24,25,26,28,29,31,32,33,35. Der var 27 artikler på engelsk og 5 på andre sprog; 3 på Kinesisk23,24,37 og 1 hver på Kroatisk17 og Thailand40.
størstedelen af undersøgelserne var fra Asien hovedsageligt Thailand, Kina, Hong Kong og Vietnam. Fjorten undersøgelser var fra Thailand16,18,20,21,26,27,28,29,30,31,33,34,39,40, fire var hver fra Kina23,24,36,37,Hong Kong11,15,22, 25 og Vietnam10,19, 35, 38, to undersøgelser var fra Hollanden9, 13 og en undersøgelse hver fra Japan14, Serbien17, UK32 og Togo41. To ud af de fire artikler fra Kina var fra epidemiologisk undersøgelse i Sichuan udbrud i 200536,37.
året, hvor undersøgelserne blev offentliggjort, varierede mellem 1983 og 2017. Antallet af patienter inkluderet i hver undersøgelse varierede fra 4 til 215 patienter.
vurdering af risiko for bias
resultaterne af vurdering af risiko for bias for de tre case-control-undersøgelser, der anvendte skalaen (NOS), var i tabel 1. Resultaterne viste forskellig kvalitet blandt tre undersøgelser. Baseret på den samlede vurdering med hensyn til “udvælgelse”, “sammenlignelighed” og “konstatering af eksponering” var der kun en undersøgelse, der opnåede en høj score 19, mens en undersøgelse hver kan klassificeres som moderat38 og lav kvalitet37.
både “selektion” og “eksponering” var generelt ret svage på tværs af de undersøgte undersøgelser. To undersøgelser anvendte samfundskontrolgrupper19, 37, mens en undersøgelse havde ikke-S. suis sepsis diagnosticeret patienter som kontrol38. Definitionen af sager blev forklaret tilstrækkeligt blandt undersøgelser med høj og moderat score opnåelse19,38, Men repræsentativiteten af sagerne blev kun angivet i en undersøgelse38.
kun en undersøgelse opnåede en høj “sammenlignelighed” kvalitetsvurdering19. Ingen af de to resterende undersøgelser justeret for confounders37,38. Blandt disse anvendte den ene undersøgelse lægejournal til konstatering af eksponering38, mens den anden brugte et spørgeskema uden at blinde de adspurgte for sag og kontrolstatus37. Ingen af undersøgelserne fremlagde oplysninger om manglende responsrate eller behandlede spørgsmålet.
den inkluderede randomiserede kontrollerede undersøgelse var lav risiko for bias baseret på RoB 2.010. Støtte til dommen blev givet i supplerende tillægstabel S2.
patientkarakteristika
blandt 32 inkluderede studier blev der rapporteret i alt 1.454 Streptococcus suis-tilfælde. Størstedelen af patienterne var mænd, der omfattede mere end to tredjedele af S. suis-tilfælde undtagen i undersøgelsen af Kerdsin et al. (2009), hvor der var et relativt højere antal kvindelige patienter sammenlignet med andre undersøgelser21. Størstedelen af tilfældene var Asiatiske, især fra Thailand, Vietnam og Kina, mens mindretal var patienter fra europæiske lande, hvor sager stort set var besættelsesrelaterede. Der var kun 15 afrikanske patienter afledt af en populationsbaseret overvågningsundersøgelse i Togo41
S. suis-patienter var generelt raske voksne, før de fik infektionen. Gennemsnitsalderen varierede mellem 37 og 63 år. En lavere gennemsnitsalder blev noteret i 2 undersøgelser16,28. Gennemsnitsalder blev rapporteret i de fleste undersøgelser9,11,13,14,15,16,18,20,22,23,24,26,29,30,31,32,33,34,35,38 mens 6 undersøgelser rapporterede værdien i median10,21,25,27,36,39. Hverken middel-eller medianalder blev rapporteret i 3 undersøgelser 17,37,41 (Se supplerende tillægstabel S1. Undersøg nøgleegenskaber).
studiepopulationen var hovedsageligt S. suis meningitis identificeret fra undersøgelser udført hos bakterielle meningitis patienter9,10,13,15,19,22,23,28,29,35,41 mens resten var patienter diagnosticeret med S. suis infektion11,14,16,17,18,20,21,24,25,26,27,31,32,33,34,38,39,40,42. Diagnosen var baseret på enten standard bakteriekultur eller realtidspolymerasekædereaktion (RT-PCR) i de fleste undersøgelser. S. suis sandsynlige eller mistænkte tilfælde defineret som tilfælde med kompatibel klinisk sygdom uden laboratoriebekræftelse blev imidlertid også inkluderet i 3 undersøgelser36,37,39. Mest menneskelige S. suis-infektioner var forårsaget af serotype 2-stamme. En forekomst af serotype 14-infektioner blev sporadisk rapporteret hovedsageligt fra det nordlige Thailand21, mens der var meget få antal serotype 14-isolater identificeret i Vietnam10. Serotype 4-stamme og untypeable serotype blev anset for at være rare9.
risikofaktorer
risikofaktorer forbundet med erhvervelse af S. suis-infektion omfattede rå svinekødsforbrug, svinerelateret besættelse, svin eller svinekødseksponering, alkoholdrikning, hudskade især under svinekødseksponering og underliggende sygdomme, der bidrager til immunkompromitterede tilstande (supplerende tillægstabel S1.). Selvom transmission ved hudslibning blev antaget at være den vigtigste infektionsvej, blev historien om hudskade under eksponering eller før infektion kun bemærket i nogle undersøgelser (9,5–100%), hvor flertallet havde en lille procentdel9,11,14,23,24,25,31,32,36.
varierende resultater blev noteret mellem undersøgelser vedrørende risikofaktorer for sygdommen. Eksponering for svin eller svinekød og relateret besættelse var de største risikofaktorer, der blev fundet i en række undersøgelser14,23,37,38,41, mens rå svinekødforbrug eller svineeksponering ikke var til stede hos omkring to tredjedele af patienterne i andre undersøgelser10,16,28,31,33,35. En høj frekvens af rå svinekødsforbrug blev fundet blandt Thailandske patienter, især i det nordlige Thailand26, 39, 40. Selvom alkoholdrikning sjældent blev rapporteret i tidligere undersøgelser, blev der fundet et relativt stort antal alkoholforbrug i nogle undersøgelser fra Thailand26,29,40.
På trods af lignende undersøgelsesdesign viste de tre case-control-undersøgelser, der var inkluderet i metaanalysen, forskellige træk. Den prospektive case-control-undersøgelse udført i Vietnam omfattede patienter med invasiv S. suis-infektion som tilfælde og to kontrolgrupper; en uovertruffen hospitalskontrolgruppe og en matchet samfundskontrolgruppe efter bopæl og alder inden for en 10 års rækkevidde, i et forhold på 1:319 der henviser til, at den retrospektive case-control-undersøgelse fra samme land rekrutterede S. suis-infektionspatienter som tilfælde og ikke-S. suis sepsis diagnosticerede patienter som kontrol38. En matchet case-control-undersøgelse i Sichuan, Kina inkluderede S. suis-inficerede patienter i case group og personer, der havde eksponering med tilfælde inden for 1 uge før diagnosen som kontroller i et forhold på mindst 1:137. Et standardiseret spørgeskema blev brugt til at undersøge disponerende faktorer i to undersøgelser19,38. Kun i den prospektive case-control-undersøgelse blev de adspurgte imidlertid blindet for case-og kontrolstatus19. I den matchede case-kontrol blev de adspurgte ikke blinde, og kun 15 ud af 29 patienter blev afhørt ansigt til ansigt, mens resten var bevidstløse, og spørgeskemaerne blev besvaret af deres slægtninge37. Lægejournalerne blev brugt til den anden undersøgelse38.
forskellige case-og kontroldefinitioner blev anvendt blandt undersøgelser. Et bekræftet S. suis-tilfælde blev generelt defineret som en indlagt patient med bekræftet S. suis-infektion enten ved blod/CSF-kultur eller realtidspolymerasekædereaktion (RT-PCR) i 2 studier19,38 hvorimod et tilfælde blev defineret som S. suis tilfælde bekræftet af enten laboratorium eller klinisk diagnose i en undersøgelse37.
definition af fællesskabskontrol var ret ens i to case-control-studier19,37 undtagen de blev tilfældigt identificeret og matchet efter alder i en undersøgelse19, mens en undersøgelse kun havde hospitalskontrolgruppe defineret som bekræftede ikke-S. suis sepsis patienter under optagelse38.
metaanalyse
i alt 850 deltagere blandt 3 inkluderede case-control-undersøgelser blev analyseret efter type kontrolgrupper (samfundskontrol og ikke-S. suis sepsis diagnosticerede tilfælde). Større risikofaktorer inklusive rå svinekødsforbrug, eksponering for svin eller svinekød, svinrelateret besættelse og hankøn viste sig at være signifikant forbundet med S. suis-infektion ifølge alle metaanalyser. Nogle nærliggende tal blev brugt på grund af forskellig kategorisering af prædisponerende faktorer. Antallet af personer, der lever i Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome (PRRS) distrikt eller tilstødende område og dem,der er involveret i svin rengøring, opskæring og forarbejdning blev brugt til at repræsentere population udsat for svin eller svinekød i den matchede case-control og retrospektive case-control undersøgelser henholdsvis 37, 38. For svinerelateret besættelse blev antallet af dem, der var involveret i slagtning, brugt til at repræsentere svinerelaterede besættelsespersoner under begrundelse for, at de fleste deltagere var landmænd, der normalt var involveret i slagteriaktivitet. Meta-analyseresultaterne for tilfældige effekter på risikofaktorer forbundet med S. suis-infektion blev præsenteret i Fig. 2A–D.