Ralph var genstand for en livlig rekrutteringskamp, en naturlig konsekvens af hendes evner, der førte til National high school player of The year Honours. Mange programmer forfulgte hende, men to skoler syntes at have bedre chancer end Connecticut. Ralphs mor, Marsha (Mann) Lake, var en amerikansk basketballspiller for University of North Carolina. North Carolina-programmet var et af de bedre programmer i landet. Ralph voksede op i North Carolina, og hendes navn var et “husholdningsord siden hun var elleve år gammel”. Et andet premier-program, University of Tennessee, var også meget interesseret i Ralph. Hovedtræner for Tennessee, Pat Summitt, var gode venner med Marsha, så mange følte, at en af disse to skoler ville have det indvendige spor.

Ralph ringede til Geno Auriemma, Connecticut-træneren, for at spørge, hvilken slags rolle han forestillede sig for hende på UConn. Det er ikke ualmindeligt, at trænere lover startpositioner og et minimum antal minutters spilletid for meget lovende rekrutter. Men Auriemma svarede: “Jeg ved det ikke. Hvis du er virkelig, rigtig god, så har du en chance for at spille meget. Men hvis du sutter, spiller du slet ikke.”Kort derefter besøgte hun et rekrutteringsbesøg hos UConn og fortalte træneren, at hun var klar til at forpligte sig til Connecticut. Hun fortsatte med at have en god seniorsæson i gymnasiet. Efter at hun vandt USA Player Of The Year-prisen, hun blev afhørt af USA Today, der spurgte om hendes rekrutteringsbeslutning. Hun forklarede, ” Coach Auriemma var den eneste træner, der fortalte mig, om jeg var rigtig god, ville jeg spille meget, og hvis jeg sugede, spillede jeg ikke.”Auriemma læste citatet i avisen og “næsten fra sin stol”. Han ringede til hende for at sige: “Jøsses, Shea. Var du nødt til at sige det i avisen?”.

Ralph deltog i University of Connecticut fra 1996 til 2001, iført ensartet nummer 33 og dimitterede med en BA i træningsfysiologi. Hun blev indskrevet på universitetet i fem år med en medicinsk redshirt i sit andet år, 1997-98. I løbet af de fire år, hun spillede en hel eller delvis sæson, havde UConn en rekord på 130-10. I Big East play tabte holdet kun to kampe på fire sæsoner for en samlet rekord på 66-2. Uconn vandt Big East regulære sæson mesterskab og efter sæsonen Big East Tournament Championship alle fire år. Huskies gik til NCAA-turneringen alle fire år, hvilket gjorde den søde seksten hver gang, og Final Four i hendes sidste to sæsoner. I 2000 var Ralph kaptajn for holdet til det nationale mesterskab og ved Final Four blev han udnævnt til turneringens mest fremragende spiller.

i sit førsteårsår (1996-97) vandt UConn-holdet hvert spil i deres regelmæssige Sæsonplan (27-0) og fortsatte med at vinde Big East-Turneringen og afsluttede en ubesejret almindelig sæson med en rekord på 30-0. Ralph blev udnævnt til Årets Big East Rookie. Hun tjente også National freshman of the year hædersbevisninger fra både USA Basketball forfattere Association og de sportslige nyheder. I den første runde af NCAA-turneringen, et spil mod Lehigh, rev Ralph imidlertid det forreste korsbånd (ACL) i hendes højre knæ. Hun kunne ikke spille resten af turneringen. Mens holdet var i stand til at vinde deres første tre NCAA-kampe uden Ralph, tabte de mod Tennessee i den regionale Finale.

Shea havde sit bedste scoringsår som sophomore med 16,7 point pr. Hun skød over 40% ud over trepunktsbuen for den sæson og 51,7% i Big East-sæsonen og satte hele tiden Big East-rekorden for trepunktsskydning i en sæson. I Big East-turneringen tjente hendes spil hende den mest fremragende Performer-pris.

i sit juniorår (1999-00) blev hun udnævnt til kaptajn for det hold, der fortsatte med at vinde det nationale mesterskab. I mesterskabet mod Tennessee scorede hun 15 point på seven of eight shooting. Hun havde også seks stjæler og syv assists, hvilket fik holdkammerat Marci Tsel til at kælenavn hendes turnering Shea. Hun blev udnævnt til årets store Østspiller. Ralph vandt også nationale priser, herunder Sports Illustrated Årets kvindelige spiller, Honda sportspris i basketball og en plads på Kodak All-America hold. Hun spillede på USA Basketball 2000 Jones Cup hold, der vandt guldet i Taipei.

i sit seniorår(2000-01) blev Ralph udnævnt til Big East First team. I løbet af sine fire år bar hun nummer 33, tidligere båret af Jamelle Elliott, nuværende UConn sports-annoncør Meghan Pattson Culmo og derefter af Barbara Turner.hendes sidste spil blev mindet i Jeff Goldbergs bog Bird at the summer, et spil, som nogle har betegnet det “største kvindelige basketballkamp, der nogensinde er spillet”. Efter en fremragende juniorsæson var Ralph mindre produktiv i begyndelsen af sin seniorsæson. Lavpunktet kom i et spil mod Big East rival Notre Dame i Januar, en match-up mellem to ubesejrede hold rangeret nummer et og nummer to i landet. (Goldberg s. 66) (Valters 239). Ralph scorede kun to point i det spil. Omkampen mellem de to hold kom i Big East Championship-spillet. Ralph startede i brand. På et tidspunkt scorede hun otte på hinanden følgende point for Huskies for at hjælpe dem med at gøre et underskud til en slank 31-28 føring. Et par minutter senere scorede hun igen og skubbede hendes scoring i alt til elleve point på 4-4 skydning sammen med seks assists og tre stjæler med over seks minutter tilbage i første halvleg. På sin næste besiddelse kørte hun imidlertid til kurven og tog et skud og snoede sig for at undgå sin forsvarer. Derefter “et foruroligende skrig gennemborer luften”, som fik kommentator Robin Roberts til at græde” Shea Ralph, Åh godhed, Åh nej”, idet han erkendte, at Ralph endnu en gang havde revet en ACL. Ved pausen fortalte Ralph sine holdkammerater, at hun lige havde “finjusteret” det, og hun ville være tilbage. UConn fortsatte med at vinde spillet på en summer-beater af Sue Bird, men Ralphs college-karriere var forbi. Ikke desto mindre tjente Ralphs samlede turneringsproduktion hende en position på All-tournament-holdet.

Shea var medlem af den indledende klasse (2006) af inductees til University of Connecticut kvinders basketball “Huskies of Honor” anerkendelsesprogram. Hun afsluttede sin college karriere med 1.678 point.

Sheas kamp med anoreksi fortsatte på college. Hendes tilstand var ikke kendt af Connecticut på tidspunktet for hendes rekruttering, men blev snart tydelig. At spille basketball var hendes første kærlighed, så benching hende fra at spille fik hende til at spise. Men det varede kun indtil hendes første ACL-tåre. Da hun ikke var i stand til at træne, mens hun rehabiliterede, bekymrede hun sig for at gå op i vægt og vendte tilbage til dårlige spisevaner. En anden ACL-tåre fik hende til at gå glip af hele sæsonen 1997-1998. Selvom skaden opstod i lavsæsonen, nyheden var betydelig nok til, at det var hovedhistorien om klokken elleve den aften i Connecticut. Det Friår overbeviste hende om, at hun havde brug for at overvinde sin anoreksi, hvis kun af ansvar over for sine holdkammerater.