Shigella fleksneri er en gram-negativ bakterie, der forårsager den mest overførbare af bakterielle dysenterier, shigellose. Shigellose forårsager 1,1 millioner dødsfald og over 164 millioner tilfælde hvert år, hvor de fleste tilfælde forekommer hos børn i udviklingslande. Patogenesen af S. fleksneri er baseret på bakteriens evne til at invadere og replikere inden i kolonepitelet, hvilket resulterer i alvorlig betændelse og epitelødelæggelse. De molekylære mekanismer, der anvendes af S. fleksneri til at krydse epitelbarrieren, undgå værtens immunrespons og komme ind i epitelceller, er blevet undersøgt grundigt i både in vitro og in vivo modeller. Derfor er adskillige virulensfaktorer, der er essentielle for bakteriel invasion, intercellulær spredning og induktion af betændelse, blevet identificeret i S. fleksneri. Betændelsen produceret af værten har været impliceret i både ødelæggelsen af kolonepitelet og i kontrol og indeholdende Shigella-infektionen. Værtens humorale respons på S. fleksneri ser også ud til at være vigtig for at beskytte værten, mens rollen af det cellulære immunrespons forbliver uklar. Værtens immunrespons på shigellose er serotype-specifik og beskyttende mod reinfektion af den samme serotype, hvilket gør vaccination til en mulighed. Siden 1940 ‘ erne vacciner til S. den voksende forståelse af S. fleksneris patogenese og værtens immunrespons hjælper med at skabe mere raffinerede vaccinestrategier. Nuværende forskning omfatter en række vaccinetyper, som på trods af forskelle i deres effektivitet og sikkerhed hos mennesker repræsenterer lovende fremskridt inden for udvikling af S. fleksneri-vaccine.