Al igual que otros inhibidores de la monoaminooxidasa, Isocarboxazida potencia la acción de una serie de medicamentos y alimentos. Los pacientes tratados con un inhibidor de la monoaminooxidasa no deben recibir agentes simpaticomiméticos de acción indirecta, como anfetaminas, metaraminol, fenfluramina o agentes anoréxicos similares, efedrina o fenilpropanolamina (contenidos en muchos medicamentos patentados para curar el resfriado), dopamina o levodopa. También se debe advertir a los pacientes que eviten los alimentos y bebidas con un alto contenido de tiramina: quesos maduros (incluidos los quesos fundidos), levaduras hidrolizadas o extractos de carne, bebidas alcohólicas, en particular vinos tintos pesados como el Chianti, cervezas sin alcohol, lagers y vinos, y otros alimentos que no son frescos y que están fermentados, encurtidos, «colgados», «madurados» o sujetos de otro modo a la degradación de proteínas antes del consumo. Las vainas de habas (que contienen levodopa) y las pieles de plátano también pueden presentar un peligro. En casos extremos, las interacciones pueden dar lugar a episodios hipertensivos graves. Por lo tanto, la isocarboxazida debe interrumpirse inmediatamente tras la aparición de palpitaciones o dolores de cabeza frecuentes.

La petidina no debe administrarse a pacientes que estén recibiendo inhibidores de la monoaminooxidasa, ya que pueden producirse reacciones graves y potencialmente mortales, como excitación central, rigidez muscular, hipertermia, colapso circulatorio, depresión respiratoria y coma. Tales reacciones son menos probables con la morfina, pero la experiencia de la interacción de isocarboxazida con analgésicos narcóticos distintos de la petidina es limitada y, por lo tanto, es necesario extremar la precaución al administrar morfina a pacientes en tratamiento con isocarboxazida.

La isocarboxazida no debe administrarse junto con otros inhibidores de la monoaminooxidasa, inhibidores selectivos de la recaptación de serotonina (ISRS) o la mayoría de los antidepresivos tricíclicos (clomipramina, desipramina, imipramina, butriptilina, nortriptilina o protriptilina). Aunque no hay pruebas de que la terapia combinada sea eficaz, los casos refractarios de depresión se pueden tratar con isocarboxazida en combinación con amitriptilina o trimipramina, siempre que se tenga el cuidado adecuado. Es probable que aumenten las reacciones hipotensoras y otras reacciones adversas.

Se debe permitir un intervalo de 1 a 2 semanas después del tratamiento con Isocarboxazida antes de la administración de antidepresivos con un modo de acción diferente o cualquier otro medicamento que pueda interactuar. Se recomienda un intervalo similar antes de la administración de isocarboxazida cuando se ha utilizado otro antidepresivo; en el caso de medicamentos con una semivida muy larga (como la fluoxetina), puede ser aconsejable extender este intervalo.

Se debe interrumpir el tratamiento con isocarboxazida durante al menos 2 semanas antes de una cirugía electiva que requiera anestesia general. Se debe advertir al anestesista de que un paciente está siendo tratado con isocarboxazida, en caso de que sea necesaria una cirugía de emergencia. La administración concomitante de isocarboxazida con otros depresores del sistema nervioso central (especialmente barbitúricos y fenotiazinas), estimulantes, anestésicos locales, bloqueantes ganglionares y otros hipotensores (incluyendo metildopa y reserpina), diuréticos, vasopresores, medicamentos anticolinérgicos y agentes hipoglucemiantes puede potenciar sus efectos. Esto se debe tener en cuenta si es necesario realizar odontología, cirugía o un cambio en el tratamiento de un paciente durante el tratamiento con isocarboxazida.

Se debe advertir a todos los pacientes que toman isocarboxazida contra la automedicación con preparaciones patentadas para curar el frío y descongestionantes nasales, y se les debe advertir de las restricciones dietéticas enumeradas en «advertencias».

Con Isocarboxazida, al igual que con otros medicamentos que actúan sobre el sistema nervioso central, se debe indicar a los pacientes que eviten el alcohol mientras estén en tratamiento, ya que no se puede prever la respuesta individual.