Hay una serie de teorías diferentes sobre los orígenes y la etimología de los huevos escoceses, y no hay una conclusión firme. El Diccionario de Inglés de Oxford da la primera instancia del nombre como 1809, en una edición de A New System of Domestic Cookery de Maria Rundell. La receta apareció en la primera edición del mismo libro en 1805. No tenían, en ese momento, una capa de migas de pan, aunque en 1861 Isabella Beeton sugirió esta opción. The Oxford Companion to Food especula que el origen puede ser koftas de la India.

Como un artículo frío, los grandes almacenes de Londres Fortnum & Mason afirma haber inventado los huevos escoceses en 1738, como aperitivo de viajero, pero se basó en material de archivo desde que se perdió. Fortnum & Mason ciertamente popularizó los huevos escoceses, incluidos los alimentos como parte de varias cestas. Generalmente se cree que los huevos escoceses a su vez derivaban de la comida que los británicos encontraban en el Raj, incluido un plato Mughlai llamado nargisi kofta («albóndigas de Narciso»).

Otras afirmaciones incluyen el nombre que proviene de un apodo utilizado por los londinenses que vivían alrededor de los Barracones de Wellington en honor a los oficiales de la Guardia Escocesa estacionados allí, y que desarrollaron un gusto por la merienda. Según las Delicias Culinarias de Yorkshire, se originaron en Whitby, Yorkshire, Inglaterra, en el siglo XIX, y originalmente estaban cubiertas de pasta de pescado en lugar de carne de salchicha. Fueron supuestamente nombrados en honor a William J. Scott & Sons, un conocido restaurante que los vendía. Sin embargo, la fecha no encaja con el uso conocido del término al menos 75 años antes. También se ha sugerido que originalmente se llamaban huevos «quemados», ya que se cocinaban a fuego abierto, aunque de acuerdo con las recetas sobrevivientes, se freían en manteca de cerdo. El ‘ scotching ‘como proceso culinario también se cita a veces como el origen, aunque lo que era el’ scotching ‘ está abierto a la interpretación, desde la inclusión de anchoas hasta simplemente picar carne. Se añade más confusión por el gran comercio de huevos de Escocia en el siglo XIX, que a veces implicaba sumergir los huevos en un polvo de lima, un proceso posiblemente también conocido como «scotching».