Véase también: Grecia antigua

La primera ciudad en el sitio de Troya fue Wilusa, fundada en el 3er milenio a.C. por los hititas, que fueron los primeros pueblos indígenas de Anatolia en levantarse para formar un estado durante la Edad del Bronce. Situada sobre la colina de Hisarlık, en el extremo noroeste de la Península de Troad, estaba claro que la razón de la existencia de la ciudad en primer lugar era un control total de los Dardanelos, que, junto con el Mar de Mármara y el Bósforo, hoy se conoce como el Estrecho de Turquía, una ruta clave que conecta el Mediterráneo con el Mar Negro, y donde las masas terrestres europeas y asiáticas están a tiro de piedra una de la otra.

El secuestro de Helena, la hija del rey de Esparta, por París, un príncipe troyano, provocó enemistad entre los troyanos y los aqueos del otro lado del mar Egeo, o eso dice la historia. Al no haber podido entrar en las murallas defensivas de la ciudad, los aqueos decidieron montar un truco: ofrecieron un enorme caballo de madera como regalo a los troyanos, como compensación por la molestia que causaban con sus galeras de guerra en la playa de la ciudad. Los troyanos aceptaron la oferta sinceramente, pero esto resultó en que perdieran su ciudad, ya que dentro del caballo había soldados aqueos, listos para luchar, y ahora justo en el centro de la ciudad.

Hubo una Guerra de Troya, que probablemente tuvo lugar en el siglo XII a.C., y fue alrededor de esta época que Wilusa hitita se convirtió en Illion helénico, y más tarde en Troia. Sin embargo, por alguna razón, todos los invasores posteriores de todas las direcciones, con la notable excepción de Alejandro Magno (cuyos oficiales fundaron la ciudad de Alejandría Troas en la costa sur de Troya), favorecieron el Bósforo al noreste en lugar de los Dardanelos para sus cruces intercontinentales. El emperador romano Constantino I (r. 306-337) también estuvo de acuerdo, fundando una nueva capital para su imperio, Constantinopla, a orillas del Bósforo. A medida que Constantinopla florecía, su rival Troya declinaba, desapareciendo finalmente bajo capas de tierra.

Desde los días del Imperio Bizantino, se pensaba que Troya no era más que la imaginación pura de Homero, pero en 1868, Heinrich Schliemann, un hombre de negocios alemán y autoproclamado arqueólogo, demostró lo contrario, después de tomar la pista de que Troya podría ser un lugar real enterrado bajo la colina Hisarlık de Frank Calvert, un arqueólogo británico que visitó el sitio tres años antes. Como las excavaciones de Schliemann eran totalmente de aficionados, dañaron la integridad de gran parte de los restos, pero Schliemann obtuvo lo que anhelaba de todos modos: su esposa griega Sophia Schliemann es inmortalizada en una foto que la muestra llevando los tesoros encontrados en la colina Hisarlık (parte del tesoro fue tomada más tarde por el Ejército Rojo de Berlín a Moscú al final de la Segunda Guerra Mundial).

Aunque ha pasado casi un siglo y medio desde los días de Schliemann, Troya todavía no ha sido desenterrada por completo, y los trabajos de excavación continúan hasta el día de hoy.

Una vez una ciudad portuaria en el borde de una profunda bahía de los Dardanelos, el sitio ahora se encuentra a 5 km tierra adentro de la costa debido al material aluvial transportado por el río Scamander (moderno Karamenderes), que llenó la bahía, convirtiéndola en las fértiles tierras de cultivo planas que se extienden hasta el mar que es.

En turco moderno, hay una tendencia a cambiar el nombre del sitio de Truva, que refleja la pronunciación del nombre francés del lugar (Troie), ya que era el idioma elegido entre la élite turca hasta la década de 1950, a Troya, que está más cerca del nombre griego original, aunque ambos todavía se pueden escuchar indistintamente.