Wafer se declaró a sí mismo como candidato de entrada temprana para el draft de la NBA de 2005 después de su segundo año en la FSU a pesar de que muchos expertos predijeron que no sería reclutado. Hubo varios obstáculos que tuvo que superar para convertirse en una opción viable para que un equipo de la NBA lo seleccionara. Wafer no fue invitado al campamento anual de pre-draft de Chicago, que ofrece a los jugadores que no son vistos como prospectos de primera ronda la oportunidad de mostrar sus habilidades frente al personal del equipo de la NBA. Durante un entrenamiento con los Phoenix Suns, Wafer se sintió frustrado por el juego físico de Jan Jagla, y respondió colocando un codo intencional en la nariz de Jagla, luego salió de la cancha y terminó el entrenamiento en ese momento. El explorador de Los Angeles Lakers, Irving Thomas, que jugó dos temporadas en la FSU, vio tres partidos de los Seminoles durante la temporada 2004-05 y ayudó a organizar un entrenamiento para Wafer con los Lakers. El gerente general de los Lakers, Mitch Kupchak, vio suficiente habilidad de Wafer que usaron la segunda de sus dos selecciones de segunda ronda para seleccionar a Wafer en el draft.

Wafer fue colocado en waivers por los Lakers el 26 de octubre de 2006. Jugó en un solo partido de pretemporada debido a un talón izquierdo magullado. Wafer luego jugó para los Colorado 14ers de la NBA Development League durante la temporada 2006-07, y fue nombrado Jugador del Mes en enero de 2007. Firmó un contrato de diez días con los Clippers de Los Ángeles el 21 de febrero. Jugó un minuto sin anotar antes de ser renunciado una semana después. El 12 de abril de 2007, los Denver Nuggets firmaron a Wafer para el resto de la temporada 2006-07.

El 21 de febrero de 2008, los Denver Nuggets cambiaron Wafer a los Portland Trail Blazers por Taurean Green. Wafer cambió su número de 22 (que llevaba con los Nuggets) a 24, ya que el número 22 había sido retirado por los Trail Blazers para honrar a Clyde Drexler.

Houston Rocketseditar

Wafer fue firmado por los Houston Rockets y logró mantener un lugar en el equipo debido a su tiro caliente en la pretemporada. El 13 de enero de 2009, Wafer anotó un récord personal de 23 puntos en tiros de 10-14 en 39 minutos contra Los Angeles Lakers. Encontró un lugar regular en la alineación titular de los Rockets debido a su buen desempeño, así como una lesión a la abridora regular Tracy McGrady. Continuó impresionando al anotar 21 puntos contra los Jazz y golpear a los tres ganadores en un juego en Boston que los Rockets ganaron 89-85. En ese mes promedió 14,3 puntos por partido. Después de que Wafer se mudara a un equipo en Grecia, los Rockets le ofrecieron un contrato a mitad de la próxima temporada. Firmó el contrato, pero falló en su examen físico, por lo que no pudo unirse a los Cohetes.

Olympiacos Piraeuseditar

Wafer se unió al club griego de la Euroliga Olympiacos Piraeus en agosto de 2009, firmando un contrato de ingresos brutos de two 10 millones por dos años. Luego fue renunciado por el Olympiacos en diciembre de 2009. Wafer disparó un 36,4% desde el campo y promedió 3,0 puntos por partido y 1,3 rebotes por partido en la Liga Griega A1 con el Olympiacos. En el juego de la Euroliga, disparó un 50% desde el campo y promedió 7,7 puntos por partido, 1,3 rebotes por partido y 1,0 asistencias por partido.

Dallas Maverickseditar

El 24 de febrero de 2010, Wafer firmó un contrato de diez días con los Dallas Mavericks. No se esperaba que rompiera la rotación durante su mandato y aunque era elegible para jugar seis partidos, Wafer terminó su contrato con Dallas sin jugar un solo minuto.

Boston Celticseditar

El 3 de julio de 2010, Wafer firmó un contrato de agente libre con los Boston Celtics. El 29 de octubre de 2010, estuvo involucrado en un altercado en el vestuario con su nuevo compañero de equipo Delonte West.

Vanoli-Braga Cremonaeditar

En agosto de 2011, durante el cierre patronal de la NBA de 2011, firmó un contrato de un año con Vanoli-Braga Cremona en Italia.

Orlando MagicEdit

Wafer fue traspasado a The Magic el 12 de diciembre de 2011, junto con Glen Davis por Brandon Bass. Fue eliminado por The Magic al final de la temporada 2011-12.

Mudarse a CBAEdit

Wafer se mudó a China en 2012, firmó un contrato de un año con Xinjiang Flying Tigers por un valor de 2 2 millones. Jugó 34 partidos para Xinjiang, promediando 26,4 puntos con un porcentaje de tiro del 55,4%. También tiene 4.4 rebotes, 3.4 asistencias y 1.1 robos por partido.

En octubre de 2013, firmó con los Shanghai Sharks, el equipo propiedad de su ex compañero de equipo Yao Ming en los Rockets. En diciembre de 2013, dejó los Tiburones.

Bakersfield Jameditar

El 10 de enero de 2014, fue adquirido por Bakersfield Jam de la NBA Development League. El 28 de enero de 2014, fue renunciado por The Jam.

RusaedItar

El 3 de febrero de 2014, firmó con BC Krasny Oktyabr para el resto de la temporada 2013-2014.

Delaware 87erseditar

El 26 de noviembre de 2016, Wafer regresó a los Estados Unidos, firmando con los Delaware 87ers de la NBA Development League.

Westchester Knickseditar

El 14 de diciembre de 2016, Wafer fue traspasado a los Westchester Knicks a cambio de Devondrick Walker.

Regreso a CBAEdit

El 27 de enero de 2017, Wafer regresó a China, firmando con los Jilin Northeast Tigers.