Sélection de l’étude

Au total, 4 999 articles ont été identifiés lors des recherches initiales à partir de huit bases de données (n= 4 997) et d’autres sources (n = 2). Il restait 682 dossiers après la suppression des doublons dans lesquels 636 citations qui étaient des procédures ou qui ne contenaient pas de facteurs de risque ont été exclues lors de la sélection du titre et du résumé. Il y avait 32 articles inclus dans la revue système5,9,10,11,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40 et 3 études cas-contrôles19,37, 38 dans la méta-analyse après évaluation des textes complets. L’organigramme PRISMA décrivant le processus de sélection de l’étude a été illustré à la Fig. 1.

organigramme PRISMA du processus de sélection de l’étude.

Caractéristiques de l’étude

Les principales caractéristiques de l’étude sont présentées dans le tableau S1 de l’annexe supplémentaire. Des études incluses avec différents modèles d’étude ont été menées dans 9 pays différents. Parmi ceux-ci, il y a eu 1 essai randomisé en double aveugle, contrôlé par placebo 10,3 études cas-témoins dans lesquelles il y a eu 1 étude cas-contrôle apparié 37, 1 étude cas-contrôle rétrospectif 38 et 1 étude cas-contrôle prospective19,28 études descriptives, y compris 3 études de surveillance de la santé publique 27,40,41, 2 enquêtes sur les éclosions 36,39 et 1 analyse épidémiologique en Chine23, une étude basée sur la population sur une campagne de salubrité des aliments30 et une cohorte rétrospective identifiant le facteur de risque de S. suis mortalité34,3 revues rétrospectives16, 20, 21 et 17 rapports de cas ou séries de cas9,11,13,14,15,17,18,22,24,25,26,28,29,31,32,33,35. Il y avait 27 articles en anglais et 5 dans d’autres langues; 3 en Chinois23, 24, 37 et 1 chacun en Croatie17 et en Thaï40.

La majorité des études provenaient d’Asie, principalement de Thaïlande, de Chine, de Hong Kong et du Vietnam. Quatorze études provenaient de la Thaïlande16,18,20,21,26,27,28,29,30,31,33,34,39,40, quatre provenaient chacun de Chine23, 24, 36, 37, Hong Kong11, 15, 22, 25 et du Vietnam10, 19, 35, 38, deux études provenaient des Pays-Bas9, 13, et une étude du Japon14, de la Serbie17, du Royaume-UNI32 et de Togo41. Deux des quatre articles en provenance de Chine provenaient d’une enquête épidémiologique sur l’épidémie du Sichuan en 200536,37.

L’année de publication des études variait entre 1983 et 2017. Le nombre de patients inclus dans chaque étude allait de 4 à 215 patients.

Évaluation du risque de biais

Les résultats sur l’évaluation du risque de biais pour les trois études cas-témoins utilisant l’échelle de Newcastle Ottawa (NOS) se trouvaient dans le tableau 1. Les résultats ont montré une qualité diverse parmi trois études. Sur la base de l’évaluation globale en termes de  » sélection « , de  » comparabilité  » et de  » détermination de l’exposition « , une seule étude a obtenu un score élevé19, alors qu’une étude peut être classée comme modérée38 et de faible qualité37.

La  » sélection » et l' » exposition » étaient généralement assez faibles dans les études examinées. Deux études ont utilisé des groupes témoins communautaires19,37, tandis qu’une étude a diagnostiqué des patients non atteints de septicémie à S. suis comme témoins 38. La définition des cas a été suffisamment expliquée parmi les études ayant obtenu des scores élevés et modérés19,38, mais la représentativité des cas n’a été énoncée que dans une seule étude38.

Une seule étude a obtenu un score élevé d’évaluation de la qualité de  » comparabilité « 19. Aucune des deux autres études n’a corrigé les facteurs de confusion37,38. Parmi celles-ci, une étude a utilisé un dossier médical pour la vérification de l’exposition 38 tandis que l’autre a utilisé un questionnaire sans aveugler les intervieweurs au statut de cas et de témoin 37. Aucune des études n’a fourni d’informations sur le taux de non-réponse ou n’a abordé la question.

L’étude contrôlée randomisée incluse présentait un faible risque de biais basé sur RoB 2.010. L’appui au jugement a été fourni dans le tableau S2 de l’annexe supplémentaire.

Caractéristiques du patient

Parmi les 32 études incluses, un total de 1 454 cas de Streptocoque suis ont été rapportés. La majorité des patients étaient des hommes, comprenant plus des deux tiers des cas de S. suis, sauf dans l’étude de Kerdsin et al. (2009) dans lesquels le nombre de patientes était relativement plus élevé que dans d’autres études21. La majorité des cas étaient asiatiques, en particulier en Thaïlande, au Vietnam et en Chine, tandis que la minorité étaient des patients de pays européens où les cas étaient en grande partie liés à l’occupation. Il n’y avait que 15 patients africains issus d’une étude de surveillance basée sur la population chez Togo41

S. Les patients de suis étaient généralement des adultes en bonne santé avant de contracter l’infection. L’âge moyen variait entre 37 et 63 ans. Un âge moyen inférieur a été noté dans 2 études16,28. L’âge moyen a été rapporté dans la plupart des études9,11,13,14,15,16,18,20,22,23,24,26,29,30,31,32,33,34,35,38 considérant que 6 études ont rapporté la valeur dans median10,21,25,27,36,39. Ni l’âge moyen ni l’âge médian n’ont été rapportés dans 3 études17,37,41 (voir le tableau S1 de l’annexe supplémentaire. Étudier les caractéristiques clés).

La population étudiée était principalement constituée de méningites à S. suis identifiées à partir d’études réalisées chez des patients atteints de méningite bactérienne9,10,13,15,19,22,23,28,29,35,41 alors que les autres étaient des patients diagnostiqués avec une infection à S. suis11,14,16,17,18,20,21,24,25,26,27,31,32,33,34,38,39,40,42. Le diagnostic était basé sur une culture bactérienne standard ou sur une réaction en chaîne par polymérase en temps réel (RT-PCR) dans la plupart des études. Cependant, les cas probables ou suspects de S. suis définis comme des cas de maladie clinique compatible sans confirmation de laboratoire ont également été inclus dans 3 études36,37, 39. Le plus humain S. les infections sont causées par une souche de sérotype 2. Une occurrence d’infections de sérotype 14 a été signalée sporadiquement, principalement dans le nord de la Thaïlande 21, alors qu’il y avait très peu d’isolats de sérotype 14 identifiés au Vietnam10. La souche de sérotype 4 et le sérotype non typable ont été considérés comme rares9.

Facteurs de risque

Facteurs de risque associés à l’acquisition de S. l’infection à suis comprenait la consommation de porc cru, l’occupation liée au porc, l’exposition des porcs ou du porc, la consommation d’alcool, les lésions cutanées, en particulier pendant l’exposition au porc, et les maladies sous-jacentes contribuant à des conditions immunodéprimées (tableau S1 de l’annexe supplémentaire.). Bien que la transmission par abrasion cutanée soit considérée comme la principale voie d’infection, des antécédents de lésions cutanées pendant l’exposition ou avant l’infection n’ont été notés que dans certaines études (9,5 à 100–) dans lesquelles la majorité avait un faible pourcent9,11,14,23,24,25,31,32,36.

Des résultats variables ont été notés entre les études concernant les facteurs de risque de la maladie. L’exposition aux porcs ou au porc et l’occupation connexe étaient les principaux facteurs de risque observés dans un certain nombre d’études14, 23, 37, 38,41, alors que la consommation de porc cru ou l’exposition au porc n’étaient pas présentes chez environ deux tiers des patients dans d’autres études10,16,28,31,33,35. Une fréquence élevée de consommation de porc cru a été observée chez les patients thaïlandais, en particulier dans le nord de la Thaïlande26,39,40. Bien que la consommation d’alcool ait rarement été signalée dans des études antérieures, un nombre relativement élevé de consommation d’alcool a été constaté dans certaines études en Thaïlande26,29,40.

Malgré une conception d’étude similaire, les trois études cas-témoins incluses dans la méta-analyse ont démontré des caractéristiques différentes. L’étude cas-témoin prospective menée au Vietnam comprenait des patients atteints d’une infection invasive à S. suis en tant que cas et deux groupes témoins; un groupe témoin hospitalier inégalé et un groupe témoin communautaire apparié par résidence et âge dans une fourchette de 10 ans, à un ratio de 1:319 considérant que l’étude cas-témoins rétrospective du même pays a recruté des patients infectés par le S. suis comme cas et des patients non atteints de septicémie diagnostiqués comme témoins 38. Une étude cas-témoins appariée dans le Sichuan, en Chine, a inclus des patients infectés par S. suis dans le groupe de cas et des individus ayant été exposés à des cas dans la semaine précédant le diagnostic en tant que témoins dans un rapport d’au moins 1: 137. Un questionnaire normalisé a été utilisé pour étudier les facteurs prédisposants dans deux études19,38. Cependant, ce n’est que dans l’étude cas-témoins prospective que les intervieweurs ont été aveuglés au statut de cas et de contrôle19. Dans le cas témoin apparié, les intervieweurs n’étaient pas aveuglés et seuls 15 patients sur 29 ont été interrogés en face à face alors que les autres étaient inconscients, et les questionnaires ont été répondus par leurs parents37. Les dossiers médicaux ont été utilisés pour l’autre étude38.

Différentes définitions de cas et de témoins ont été utilisées parmi les études. Un cas confirmé de S. suis était généralement défini comme un patient admis avec une infection confirmée de S. suis soit par culture de sang/LCR, soit par réaction en chaîne par polymérase en temps réel (RT-PCR) dans 2 études19,38, alors qu’un cas était défini comme S. cas de suis confirmé par un diagnostic de laboratoire ou clinique dans une étude37.

La définition des témoins de la communauté était assez similaire dans deux études cas-contrôles19,37, sauf qu’ils ont été identifiés au hasard et appariés selon l’âge dans une étude19 alors qu’une étude n’avait défini que le groupe témoin de l’hôpital comme des patients confirmés non atteints de septicémie à S. suis au cours de l’admission38.

Méta-analyse

Un total de 850 participants parmi les 3 études cas-témoins incluses ont été analysés par type de groupes témoins (témoins communautaires et cas non diagnostiqués de septicémie à S. suis). Les principaux facteurs de risque, y compris la consommation de porc cru, l’exposition aux porcs ou au porc, la profession liée au porc et le sexe masculin, ont été significativement associés à l’infection à S. suis selon toutes les méta-analyses. Certains nombres proches ont été utilisés en raison d’une catégorisation différente des facteurs prédisposants. Le nombre de personnes vivant dans le district ou la zone adjacente du syndrome reproducteur et respiratoire porcin (SRP) et celles qui participent au nettoyage, à la découpe et à la transformation du porc ont été utilisés pour représenter la population exposée aux porcs ou au porc dans les études cas-témoins appariées et les études cas-témoins rétrospectives respectivement37,38. En ce qui concerne la profession porcine, le nombre de personnes impliquées dans l’abattage a été utilisé pour représenter les individus de la profession porcine sous prétexte que la plupart des participants étaient des agriculteurs qui participaient habituellement à une activité d’abattage. Les résultats de la méta-analyse à effets aléatoires sur les facteurs de risque associés à l’infection à S. suis ont été présentés à la Fig. 2A-D.

La consommation de porc cru était significativement plus élevée parmi les cas que chez les témoins et beaucoup plus prononcée dans l’étude de Houng et al. dans lequel le groupe témoin était de non-S. Cas de septicémie Suis (Fig. 2 BIS) 38. À l’inverse, l’estimation globale était plus forte parmi les études avec des témoins dérivés de la communauté pour l’occupation liée au porc, alors qu’une association positive plus faible a été notée lorsque le groupe témoin était des patients non atteints de septicémie à S. Suis (Fig. 2C) 19,37,38 et était près de 6 fois plus élevé dans les cas que les témoins dans l’étude avec des témoins provenant de patients atteints de septicémie non S. suis hospitalisés 38.

L’exposition des porcs ou du porc était environ 3 à 4 fois plus élevée dans les cas que chez les témoins parmi les études avec des témoins provenant d’hôpitaux non-S. La septicémie est diagnostiquée chez les patients et la communauté respectivement (Fig. 2B) 19,37,38. Les résultats étaient cohérents entre toutes les analyses et il y avait une hétérogénéité non significative. Il a été constaté que les études portant sur des témoins communautaires19,37 montraient généralement des valeurs plus précises que celles portant sur des témoins provenant de cas de septicémie non S. suis38.

Manifestations et résultats cliniques

La méningite était la présentation clinique la plus fréquente, suivie de la septicémie et de l’arthrite dans lesquelles des cas d’arthrite septicémique subséquente ont également été rapportés (tableau S1 de l’annexe supplémentaire). Le spectre des signes et des symptômes des présentations était calme et similaire d’une étude à l’autre. La majorité des patients atteints de méningite ont développé des symptômes classiques de méningite, notamment des maux de tête sévères, une forte fièvre, une raideur de la nuque et un changement d’état mental9. Des pétéchies ou d’autres anomalies cutanées étaient présentes dans quelques études allant de 3% à 7 % chez les méningites de S. suis9,10, 22.

L’endocardite était généralement moins fréquente alors que l’endoptalmie et la spondylodiscite étaient 38 considérées comme des manifestations rares. En revanche, il a été constaté que l’endocardite infectieuse figurait parmi les présentations cliniques les plus courantes observées dans deux séries de cas, même si aucune maladie cardiaque sous-jacente n’était observée chez la plupart des patients inclus11,33. Le site de végétation le plus fréquent trouvé était l’implication aortique 33. La proportion de cas ayant développé un syndrome de choc toxique (SAT) était assez faible, environ 2 à 28 % dans la majorité des études10,11,18,34,35,36,39 sauf dans 2 études épidémiologiques en Chine (62% et 50%) 24,37. Le syndrome de choc toxique (TSS) et l’endocardite subaiguë (SBE) ont été associés à un taux de mortalité élevé selon une série de 43 patients de Thaïlande, 80% et 50% chez les patients atteints de TSS et de SBE respectivement 18. Les cas de TSS étaient plus jeunes avec une période d’incubation plus courte, un taux total de protéines sériques et d’anticorps inférieur à celui des patients non TSS18.

La période d’incubation a été fournie dans 14 études, le temps médian entre l’exposition et l’apparition se situant entre 1 et 4,8 jours9,10,11,16,17,18,24,25,27,29,30,34,36,41. La plupart des infections sont survenues pendant les mois d’été11,15,22,25,35,36 ou la saison des pluvies20, 26, 33.

Le taux de mortalité de la maladie était faible par rapport à la méningite causée par d’autres agents (0-33,3%) 9,10,11,14,16,17,18,20,21,22,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,38,39,41. Cependant, l’incidence de la surdité était élevée dans la majorité des études et en grande partie des séquelles du syndrome de méningite (7-93%) 9,10,11,13,14,15,16,17,18,20,21,22,24,25,26,28,29,30,31,32,33,34,35,38,40,41. La perte auditive était généralement permanente une fois qu’elle avait déjà commencé, même après un traitement réussi de la méningite22. Une dysfonction vestibulaire ou une ataxie était également fréquente (8-80 %)11,17,24,26,29,32,35 et était présente dans la moitié des cas de méningite dans une série de cas26, tandis qu’une perte visuelle a été notée dans quelques études (4-60 %)17,35,41.

Les décès étaient principalement dus à d’autres complications plutôt qu’à une méningite, notamment une défaillance de plusieurs organes33, une coagulation intravasculaire disséminée (CID)22,31, une péritonite bactérienne, une septicémie et une endocardite infectieuse 31. Le taux de rechute était faible et normalement traité avec succès par la poursuite de la pénicilline ou un traitement combinaire9.

Traitements

La plupart des isolats de S. suis étaient sensibles à la pénicilline ou aux céphalosporines 10,11,14,15,22,25,29,33,41. Le traitement par la pénicilline G intraveineuse à forte dose a été très efficace chez la majorité des patients22. La moyenne de la concentration minimale inhibitrice (CMI) de la pénicilline variait de 0,015 à 0,06 mg/mL11,14,15,22,31,33. La résistance aux tétracyclines et aux macrolides était courante10, 11, 14, 25,41, tandis que peu de cas de résistance aux antimicrobiens multiples ont été notés31.

La durée moyenne du traitement variait de 7 à 42 jours10,11,13,16,20,21,27,29,30,31,34,35,36,38. Une durée de traitement plus longue était généralement nécessaire en cas de complications telles que la méningite, la spondylarthrite et l’endocardite 31,33. L’association comprenant de la pénicilline ou de la céphalosporine et de l’aminoglycoside s’est avérée efficace dans le traitement de l’endocardite infectieuse33.

Le traitement adjuvant par la dexaméthasone s’est avéré réduire le risque de perte auditive et de complications neurologiques selon l’essai randomisé en double aveugle, contrôlé par placebo inclus10. En revanche, l’effet des stéroïdes contre la protection contre la perte auditive n’a pas pu être établi selon les deux séries de cas inclus26,35.