En 1256, Laurent de Saint-Martin, évêque de Rochester, obtint du pape Alexandre IV la canonisation de Guillaume. Un début fut immédiatement fait avec son sanctuaire, situé d’abord dans la crypte, puis dans le transept nord-est, et attira des foules de pèlerins. Au même moment, une petite chapelle a été construite sur le lieu du meurtre, qui s’appelait par la suite Palmersdene. Des vestiges de cette chapelle sont encore visibles près de l’actuel hôpital St William, sur la route menant de Horsted Farm à Maidstone.

Le sanctuaire de St William de Perth est devenu un lieu de pèlerinage après le sanctuaire de Saint Thomas Becket de Canterbury, amenant plusieurs milliers de pèlerins médiévaux à la cathédrale. Leurs pas ont usé les marches de pèlerin en pierre d’origine, et de nos jours, ils sont recouverts de marches en bois. Margaret Darcy, d’Essex, dans son testament, a exprimé le souhait que sa servante, Margaret Staunford, se rende en pèlerinage à « Seint Willyam de Rowchester ».

Les 18 et 19 février 1300, le roi Édouard Ier fait deux donations de sept shillings au sanctuaire. Des offrandes au sanctuaire ont également été enregistrées pour la reine Philippa (1352). Le 29 novembre 1399, le pape Boniface IX accorde une indulgence à ceux qui visitent le sanctuaire et font l’aumône à certains jours précis. Les populations locales ont continué à faire des legs aux 15e et 16e siècles.

Les armoiries de l’évêque de Rochester se composent de la croix de Saint André avec une coquille Saint-Jacques en son centre, qui représenterait Guillaume; André étant le saint patron de l’Écosse et les coquilles Saint-Jacques étant le symbole du pèlerinage. St. William est représenté dans une peinture murale, découverte en 1883 dans l’église de Frindsbury, près de Rochester, qui aurait été peinte vers 1256-1266.

Sa fête officielle est le 23 mai, bien qu’il y ait une autre fête célébrée le 22 avril. Il est le saint patron des enfants adoptés. Dans le film St. Vincent, St William est présenté dans un rapport scolaire par l’un des personnages principaux, Oliver, qui le trouve intéressant principalement parce qu’il est lui-même adopté.

L’école primaire St William of Perth, à Rochester, porte son nom.