Les genres prédominants dans le microbiote colique humain sont Bacteroides et Prevotella, qui appartiennent aux principaux phyla Bacteroidetes. Leur composition et leurs activités métaboliques sont largement modulées par l’alimentation et, en outre, elles peuvent également affecter le métabolisme des aliments. Prevotella est associée à des régimes riches en plantes (niveaux élevés de glucides complexes et apport en fruits et légumes), tandis que Bacteroides est liée à un apport élevé en graisses et en protéines. Les espèces Bacteroides et Prevotella ont leurs propres habitats spécifiques dans le corps humain car elles sont antagonistes.

Prevotella est un grand genre qui comprend près de 40 espèces différentes avec une grande diversité génomique. La plupart peuvent être isolées de la cavité buccale et de l’intestin, Prevotella copri étant l’espèce la plus abondante dans ce dernier. Les génomes des espèces de Prevotella peuvent s’adapter à leur habitat dans le corps humain et il existe une grande variabilité des souches entre les hôtes humains.

Il a été suggéré que Prevotella est une bactérie bénéfique car elle est associée à un régime alimentaire riche en plantes, mais elle est également liée à des affections inflammatoires chroniques, telles que l’arthrite et l’activation des cellules T muqueuses et systémiques dans l’infection par le virus de l’immunodéficience humaine de type 1 (VIH-1) non traitée.

Selon une étude récente menée par des scientifiques de l’Université de Göteborg, Prevotella pourrait être une bactérie critique pour un microbiote sain. Une intervention de régime alimentaire de grains d’orge de 3 jours chez des individus en bonne santé a amélioré les réponses au glucose et à l’insuline, mais uniquement avec une augmentation de l’abondance de P. copri. De plus, le traitement par P. copri (DSM 18205), dérivé des fèces humaines vivantes, chez des souris exemptes de germes sans changement de régime alimentaire a conduit à une amélioration de la tolérance au glucose en favorisant une augmentation du stockage hépatique du glycogène.

Outre ses effets bénéfiques sur le métabolisme du glucose, la souche P. copri CB7 (JCM 13464; DSM 18205) a été lié à une inflammation chronique chez les personnes infectées par le VIH, cette souche étant la seule utilisée dans les études jusqu’à présent. Comme mentionné précédemment, cependant, cette souche a également été liée à des effets bénéfiques. Il est donc pertinent de considérer le contexte comme un facteur important lors de l’évaluation des effets de Prevotella sur la santé de l’hôte.

En conclusion, la diversité génomique des souches de Prevotella peut contribuer à expliquer en partie les différences observées dans ses réponses à l’alimentation et aux conditions de santé entre les hôtes humains. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour approfondir le potentiel génétique de Prevotella et ses interactions avec son hôte et d’autres bactéries à des fins thérapeutiques en pratique clinique.