Anciennement connu sous le nom de Cardinals de Savannah, l’équipe a joué sa saison inaugurale en 1984, affiliée aux Cardinals de Saint-Louis. En 1996, l’équipe change de nom pour devenir les Sand Gnats et devient une filiale des Dodgers de Los Angeles. L’équipe a été affiliée aux Rangers du Texas de 1998 à 2002 et aux Expos de Montréal/ Nationals de Washington de 2003 à 2006.

Les Moucherons de sable ont joué leurs matchs à domicile au Grayson Stadium. Ouvert en 1927, le Grayson Stadium a accueilli 4 700 fans à l’époque où les Moucherons de sable étaient le domicile des Sand Gnats. Les Moucherons de sable ont remporté quatre championnats SAL (1993, 1994, 1997, 2013).

Le 11 janvier 2007, les Moucherons de sable nomment Tim Teufel comme manager pour la saison 2007.

Le 8 mai 2007, Jorge Reyes, un lanceur des Sand Gnats, est suspendu pour violation de la politique de la Ligue mineure de Baseball sur la toxicomanie. Reyes a été le premier joueur à recevoir une suspension de 100 matchs pour sa deuxième violation.

Le 20 mars 2008, Hardball Capital, basé à Atlanta, a acheté les Savannah Sand Gnats.

Parmi leurs anciens élèves notables figurent Adrián Beltré, Jacob DeGrom, Éric Gagné, Edwin Encarnación, Michael Fulmer, Travis Hafner, Hank Blalock, Steven Matz, Collin McHugh, Brandon Nimmo, Josh Whitesell, Josh Satin et Ryan Zimmerman.