Crocodylus intermedius est une espèce de crocodile qui est la plus menacée. La population connue la plus importante de cette espèce se trouve dans le système de la rivière Cojedes (SRC), au Venezuela, une zone soumise à une forte pression humaine. Sur la base des dénombrements nocturnes, la population du crocodile de l’Orénoque dans le SRC a été estimée à un minimum de 547 individus (hors progéniture). Les sections de la partie centrale de la SRC, en particulier vers la fin du Caño de Agua, ont montré les indices de population les plus élevés (7,3 ind / km). Des indices de population intermédiaires ont été observés dans Cojedes Norte et Caño de Agua Norte (2,2 et 4,4 ind / km, respectivement), des sections du SRC relativement proches de centres urbains importants et, comparativement, des niveaux élevés d’altération et de pollution de l’habitat. Les indices de population les plus bas (< 1,0 ind/km) ont été observés dans les sections navigables du SRC loin des grands centres urbains. La population de crocodiles dans les sections nord du SRC était dominée par les juvéniles, tandis que les sous-adultes et les adultes représentaient une fraction importante de la population dans les endroits où la densité de crocodiles était relativement élevée.