Kramer a participé à cinq matchs de sa saison recrue en 1977, avec un départ et quatre rôles de remplaçant en tant qu’héritier apparent du remplacement de Fran Tarkenton, bien que lorsqu’il a été blessé en fin de saison, Bob Lee serait le partant pour quatre des cinq derniers matchs. Lors du 12e match de l’année, les Vikings s’inclinent 24-7 au quatrième quart contre les 49ers de San Francisco et Kramer est appelé pour remplacer Bob Lee. Kramer allait 9-sur-13 pour 188 yards avec trois touchdowns pour gagner 28-27. La semaine suivante, il effectue son premier départ contre les Raiders d’Oakland. Il a réussi 16 sur 34 pour 177 verges avec un touché et trois interceptions dans la défaite 35-13. L’année suivante, Kramer se retrouve en service de nettoyage alors que Tarkenton commence chaque match pour sa dernière saison. Pour la saison 1979, Kramer sera entièrement installé en tant que starter.

Il a gagné le surnom de « Tommy de Deux minutes » pour sa réputation avec les retours, car il conduirait les Vikings à 19 retours (et un en séries éliminatoires), dont quinze au quatrième trimestre, avec quatre de Kramer en 1980 et 1985 chaque année. Cependant, Kramer serait en proie à des blessures au cours de ses onze saisons passées avec les Vikings, puisqu’il a commencé 109 des 152 matchs possibles pour l’équipe au cours de son mandat, et il n’a commencé chaque match d’une saison que deux fois (1979 et 1982), en proie à des blessures au genou et à l’épaule pour accompagner les commotions cérébrales. Il avait des blessures au genou et à l’épaule, de multiples commotions cérébrales et une blessure à la colonne vertébrale de pré-saison en 1987 qui, a-t-il déclaré, « a pratiquement mis fin à ma carrière. »

1980 a été un moment charnière pour lui et les Vikings. Il avait une fiche de 8-7 en tant que partant tout en menant les Vikings aux séries éliminatoires pour la première fois depuis 1978. Il a lancé 3 397 verges avec 23 touchés contre 24 interceptions tout en ayant un pourcentage d’achèvement de 55,7. Il a sauvé son meilleur pour la quasi-dernière de la saison. Face aux Browns de Cleveland dans l’avant-dernier match de la saison régulière, il participerait à un moment emblématique pour les Vikings, alors qu’il lançait une passe de Je vous salue Marie gagnante avec six secondes à faire. Ils avaient mené 23-9 au quatrième quart, mais Kramer a lancé trois passes de touché au cours du quart, dont deux à Ahmad Rashād en fin de match. Sur le dernier jeu du match, Rashad était regroupé dans un groupe de défenseurs des Browns mais a réussi à attraper le ballon et à se transporter dans la zone des buts. La pièce, connue sous le nom de Miracle au Met, a remporté un titre de division pour les Vikings. Kramer a connu son meilleur match à ce moment-là, lançant 38 sur 49 pour 456 verges avec quatre touchés. Il est toujours le seul quarterback des Vikings à lancer sur plus de 450 yards. En séries éliminatoires cette année-là, il affronte les Eagles de Philadelphie. Bien qu’ils menaient 14-7 à la mi-temps, une série de revirements a mené à une défaite 31-16, et Kramer a lancé 19 sur 39 pour 209 verges avec un touché et cinq interceptions.

En 1982, Kramer mène les Vikings aux séries éliminatoires avec une fiche de 5-4 écourtée. Face aux Falcons d’Atlanta au Minnesota, les Falcons ont mené au quatrième quart 21-16 avant que Kramer ne les mène à un retour pour remporter une victoire de 30-24. Il a lancé 20 sur 34 pour 253 verges avec deux passes de touché et une interception pour mener les Vikings au deuxième tour des séries éliminatoires. Face aux Redskins de Washington la semaine suivante, Kramer n’a pas pu tout à fait générer de magie, puisque Washington l’a emporté 21-7 sur son chemin vers le Super Bowl. Kramer a lancé 18 sur 39 pour 252 verges.

Kramer a eu son dernier coup d’éclat en 1986. Il a remporté 7-6 lors de ses treize départs tout en lançant pour 3 000 verges avec 24 passes de touché contre 10 interceptions tout en menant la ligue au classement des passeurs avec 92,6. Kramer a connu sa journée de gloire le 28 septembre 1986, alors qu’il a enflammé les Packers de Green Bay pour six passes de touché (dont quatre au premier quart) sur une journée de 16 sur 25 pour 241 verges. Il a été nommé au Pro Bowl pour la première et unique fois. C’était la dernière saison avec lui comme titulaire principal pour la plupart des matchs (il a commencé 13). En 1987, Kramer partagera le temps avec Wade Wilson (qui faisait partie de l’équipe depuis 1981), Kramer commençant cinq matchs et Wilson sept, Kramer notant une blessure à la colonne vertébrale avant la saison comme la blessure qui a précipité sa fin de carrière. Kramer a lancé quatre passes de touché contre trois interceptions dans ses 81 passes pour six apparitions au jeu. Kramer était le quart partant lorsque les Vikings se sont faufilés dans les séries éliminatoires à 8-7, bien qu’il ait été retiré après quelques entraînements pour Wilson. Kramer (qui a été blessé sur le premier jeu du match) a été 5 sur 9 sur 50 verges alors que les Vikings ont remporté une victoire 44-10 sur les Saints de la Nouvelle-Orléans avec Wilson à la barre. De là, les Vikings se sont rendus au match de championnat NFC avec Wilson commençant les deux prochains matchs. Pour 1988, il a effectué six départs avec des apparitions dans quatre autres matchs. Alors qu’il menait 4-2, il a lancé pour 1 264 verges avec cinq touchés contre neuf interceptions sur 173 tentatives de passes au total. En 1989, il termine sa carrière chez les Vikings avec des apparitions dans huit matchs et quatre départs tout en lançant 906 yards et sept touchdowns et interceptions. Sa dernière apparition dans un uniforme des Vikings a été un devoir de nettoyage à la fin d’une défaite en séries éliminatoires contre San Francisco. Il a réussi 9 sur 19 pour 110 verges et une interception dans la défaite de 41-13. Il a été libéré après la saison.

Il a été signé par les Saints de la Nouvelle-Orléans en 1990. Il n’est apparu que dans un seul match pour les Saints (contre les Vikings) et a pris sa retraite après la saison 1990.