La plupart des souches sont très adaptées à un cycle de vie asexué. En l’absence de méiose, la plasticité chromosomique est la norme et différentes souches ont des nombres et des tailles de chromosomes différents. La plupart des cellules ont de nombreux noyaux, certaines cellules végétatives en possédant plus de 100. Divers facteurs génétiques asexués, tels que la recombinaison parasexuée, la mutation et d’autres processus contribuent à la variation entre les noyaux d’un seul organisme (thalle). Ainsi, les champignons sont très adaptables et évoluent rapidement. Il existe une grande diversité dans le génotype et le phénotype des souches sauvages.

Alors que les souches sauvages sont très adaptables et peuvent être hétérokaryotes (contiennent des noyaux de génotype différent au sein d’un seul organisme, et donc très variables), les souches utilisées pour le biocontrôle en agriculture commerciale sont, ou devraient être, homokaryotes (les noyaux sont tous génétiquement similaires ou identiques). Ceci, associé à un contrôle serré de la variation par dérive génétique, permet à ces souches commerciales d’être génétiquement distinctes et non variables. Il s’agit d’un élément de contrôle de qualité extrêmement important pour toute entreprise souhaitant commercialiser ces organismes.