a későbbi, publikálatlan filozófia időszaka.
a szabadságról szóló műben kialakult álláspont képezi Schelling későbbi filozófiájának alapját, amely az 1810-től haláláig tartó időszakot öleli fel, amelyet csak a kiadatlan mű vázlata ismer meg Die Weltalter (1811-ben írták; a világ korszakai) és későbbi előadásainak kéziratai révén. A Die Weltalterben Schelling Isten történetét akarta elmesélni. Isten, aki eredetileg egy csendes vágyakozásba merül, önmagához jön, amikor meglátja magában azokat a gondolatokat, amelyek révén tudatára ébred önmagának. Ez az öntudat, amely azonos a szabadsággal, képessé teszi Istent arra, hogy ezeket az eszméket önmagából vetítse ki—vagyis megteremtse a világot.
Schelling kinevezése a Berlini Egyetem 1841-ben adott neki lehetőséget ismét fejleszteni a közérdek az ő elképzeléseit. Az akkori porosz király, Frigyes Vilmos IV, remélte, hogy Schelling harcolni fog az ún sárkány magja Hegelizmus Berlinben, ahol Hegel 1831-ben bekövetkezett haláláig dolgozott. Schelling első berlini előadása megmutatta öntudatát. Schelling kijelentette, hogy fiatalkorában új fejezetet nyitott a filozófiatörténetben, és most érettségében meg akarja fordítani ezt az oldalt, és újabbat akar kezdeni. Olyan neves személyek voltak a hallgatóságában, mint Friedrich Engels, S. D. O. D. Kierkegaard, Jakob Burckhardt és Mihail Bakunyin. Schellingnek azonban nem volt nagy sikere Berlinben. Sőt, elkeseredett volt, amikor előadásait plagizálta egy ellenfél, aki Schelling pozitív filozófiáját akarta benyújtani, amelyet most végre nyilvánosságra hoztak ezekben az előadásokban, a nyilvánosság elé vizsgálatra. Schelling pert indított, de elvesztette az ügyet. Lemondott és abbahagyta az előadásokat.
ezeknek a záró előadásoknak a tartalma azonban Schelling kreatív tevékenységének csúcspontját jelentette. Schelling a filozófiát negatív filozófiára osztotta, amely egyedül az értelem segítségével fejlesztette ki Isten gondolatát, ezzel szemben egy pozitív filozófiát, amely megmutatta ennek az elképzelésnek a valóságát azáltal, hogy a világ tényétől a posteriori Istenhez, mint teremtőjéhez érvelt. Schelling ezután elmagyarázta (utalva a szabadságról szóló munkájára), hogy az ember, aki egyenlő akart lenni Istennel, felállt Isten ellen bűnbeesésében. Isten azonban hamarosan újra felemelkedett, mint elv. A mitológia korában Isten sötét hatalomként jelent meg. A kinyilatkoztatás korában azonban Isten Krisztus alakjában nyilvánvalóan valóságosként jelent meg a történelemben. Így a vallás teljes történetét filozófiai gondolkodáson keresztül kell közvetíteni.