Melki Adso elmeséli, hogy 1327-ben fiatal Ferences kezdőként (a regényben Bencés) mentorával, Baskerville-i Vilmos Ferences baráttal egy észak-olaszországi Bencés apátságba utaztak, ahol a ferencesek a pápai követekkel vitatták meg Krisztus szegénységét. Az apátság híres scriptoriummal büszkélkedhet, ahol az írástudók másolnak, lefordítani vagy megvilágítani a könyveket. Az Otrantói Adelmo szerzetest— egy fiatal, de híres kéziratos megvilágítót-gyanúsan holtan találták egy domboldalon egy torony alatt, amelynek csak egy ablaka volt, amelyet nem lehet kinyitni. Az apát segítséget kér Williamtől, aki híres deduktív erejéről. Williamet vonakodva vonzza az intellektuális kihívás és az a vágy, hogy megcáfolja a démoni bűnös félelmeit. William attól is tart, hogy az apát megidézi az inkvizíció tisztviselőit, ha a rejtély megoldatlan marad.William gyorsan arra a következtetésre jutott, hogy Adelmo öngyilkosságot követett el, miután kiugrott egy közeli toronyból, amelynek ablaka volt, és hogy a domb lejtése miatt a test a másik torony alá gurult. William megoldása röviden eloszlatja a szerzetesek félelmeit, amíg egy másik szerzetest holtan nem találnak, baljóslatúan lebeg a disznóvér kádjában. Az áldozat Venantius, görög fordító és az utolsó ember, aki beszélt Adelmóval. A holttest fekete foltokat visel az ujján és a nyelvén. A fordító halála feléleszti a szerzetesek félelmeit egy természetfeletti tettestől, a félelmek megerősödtek, amikor a Casale-i Szent Fransciscan szerzetes Ubertino figyelmezteti, hogy a halálesetek hasonlítanak a Jelenések könyvében említett jelekre. A scriptoriumban William megvizsgálja Adelmo íróasztalát, de Berengar testvér, a könyvtáros asszisztens blokkolja. Malachia testvér, a főkönyvtáros megtagadja Williamtől az épület többi részéhez való hozzáférést.William találkozik Salvatore-ral, egy őrült púpossal, és védelmezőjével, Remigio da Varagine-nal, a pincérrel. William arra a következtetésre jut, hogy mindketten Dulciniták voltak, egy eretnek, militáns szekta tagjai, amely úgy véli, hogy a papságot elszegényíteni kell. William azonban nem gyanítja őket gyilkossággal, mert a Dulciniták gazdag püspököket céloznak meg, nem szegény szerzeteseket. Ennek ellenére Remigio múltja előnyt biztosít Williamnek az apátság titkainak megismerésében. Salvatore elmondja Williamnek, hogy Adelmo keresztezte az utat Venantiusszal azon az éjszakán, amikor Adelmo meghalt. Eközben Adso találkozik egy gyönyörű, félig vad parasztlánnyal, aki beoson az apátságba, hogy szexuális kedvezményeket cseréljen ételre, és elcsábítja.aznap este visszatérve Venantius íróasztalához, William talál egy görög nyelvű könyvet és egy görög írású pergament, az Adelmo által a könyvek megvilágításához kevert színű foltokat, valamint egy balkezes ember által láthatatlan tintával írt rejtélyes szimbólumokat. Berengar besurran a sötét scriptoriumba, elvonja William figyelmét és ellopja a könyvet.

Berengart később fürdőbe fulladva találják, és a Venantiushoz hasonló foltokat hordoznak. William elmondja következtetéseit, miszerint Adelmo halála valóban öngyilkosság volt, mivel engedett Berengar homoszexuális szívességek iránti kéréseinek. Venantius pergament kapott Adelmótól Adelmo halála előtt, Berengar pedig az egyetlen balkezes ember az apátságban. William elmélete szerint a fordító átírta a görög jegyzeteket a pergamenre egy könyvből, és hogy a könyv valahogy felelős a halálért. Az apát nincs meggyőződve arról, hogy a pergamen elégetésével tájékoztatja Williamet, hogy az inkvizíciót — Bernardo Gui személyében, William régi ellenfele, aki korábban inkvizítor volt — már megidézték.

elhatározták, hogy megoldják a rejtélyt, mielőtt Gui megérkezik, William és Adso felfedeznek egy hatalmas, rejtett könyvtárat a scriptorium felett. William gyanítja, hogy az apátság elrejtette a könyveket, mert tartalmuk nagy része pogány filozófusoktól származik. Gui megtalálja Salvatore-t és a parasztlányt, akik egy fekete kakasért harcolnak egy fekete macska jelenlétében. Gui számára ez a boszorkányság megcáfolhatatlan bizonyítéka, és Salvatore-t hamis vallomássá kínozza. Amikor mind Vilmos Ferences testvérei, mind a pápai küldöttek megérkeznek, megkezdődik a vita. Az apátság gyógynövényese, miután elmondta Williamnek, hogy görög nyelven írt könyvet talált a gyógyszertárában, meggyilkolja az, amiről kiderül, hogy Malachia. Ez utóbbi becsapja Remigiót, hogy megpróbáljon elmenekülni, aminek következtében Gui őrei letartóztatják és a gyilkosságokkal vádolják.Remigio, Salvatore és a lány bíróság elé kerülnek. Emlékezve Williamre, Gui úgy dönt, hogy csatlakozik az apát mint Törvényszék bíró. A tárgyaláson Remigio büszkén vallja be Dulcinita múltját, és Gui kínzással való fenyegetése alatt hamisan bevallja a gyilkosságokat. William rámutat, hogy a gyilkosságok a görög könyvhöz kapcsolódnak, amelyet Remigio nem tudott elolvasni, és figyelmezteti, hogy Remigio kivégzése nem fogja befejezni a gyilkosságokat. Gui gondoskodik arról, hogy a foglyokat máglyán égessék el, míg Williamet Avignonba viszik. A pápai küldöttek elítélik a ferenceseket Vilmos makacssága miatt, és véget vetnek a vitának.

ahogy a szerzetesek Gui foglyainak elégetésére készülnek, Malachia haldoklik, fekete foltokkal a nyelvén és az ujján. Bár Malachia halála igazolja William figyelmeztetését, Gui bizonyítékként veszi figyelembe, hogy William A gyilkos, és elrendeli letartóztatását. GUI őrei elől menekülve William és Adso újra belépnek a titkos könyvtárba, és szemtől szembe kerülnek a vak tiszteletreméltó Jorge-val, az apátság legrégebbi lakójával. Miután dekódolta a fordító pergamen vonalait, William azt követeli, hogy Jorge fordítsa át azt a könyvet, amelyet a halottak olvastak: Arisztotelész második poétikai könyve a vígjátékról. Jorge gyűlöli a nevetést, mert azt gondolja, hogy aláássa az Istenbe vetett hitet, és egy arisotle által írt nevetésről szóló könyv csak nevetést hoz a bölcseknek, és aláássa a tanulás hitét. Ennek megakadályozása érdekében Jorge megölte azokat, akik elolvasták a könyvet, megmérgezve annak oldalait. Jorge odaadja a könyvet Williamnek, azt gondolva, hogy ő is szenvedni fogja a mérget. Amikor William elárulja, hogy kesztyűt visel, Jorge megragadja a könyvet, majd lángot indít, amely gyorsan elnyeli a könyvtárat. William itt marad, megpróbálja megmenteni néhány könyvet, és bátorítja Adso-t, hogy távozzon. Jorge megöli magát a méreggel bevont oldalak elfogyasztásával.

látva a tüzet, a szerzetesek elhagyják a foglyokat, lehetővé téve a helyi parasztok számára, hogy megmentsék a lányt, bár Salvatore és Remigio meghalnak. Adso üldözi Gui – t, akinek sikerül elmenekülnie tőle, de a parasztok letolják a kocsiját egy szikláról, felnyársalva. Ahogy William és Adso távoznak, Adso találkozik a lánnyal, megáll néhány másodpercre, de végül úgy dönt, hogy Williammel megy. A sokkal idősebb Adso kijelenti, hogy soha nem bánta meg döntését, mivel még sok mindent megtanult Williamtől, mielőtt útjaik elváltak. Azt is mondja, hogy a lány volt életének egyetlen földi szerelme, de soha nem tanulta meg a nevét.