a biológiai faj fogalma a fajokat ténylegesen vagy potenciálisan keresztező egyének csoportjaként osztályozza. Ez azt jelenti, hogy a csoporton belül bármelyik két egyed (egy hím és egy nőstény) termékeny utódokat tud nemzeni és szülni. Ezt a definíciót gyakran használják, de vannak problémák vele, és olyan helyzetekben, amelyekben nem használható. 1) nem minden faj szaporodik szexuálisan 2) nem alkalmazható a fosszilis rekordra a filogenetikai megközelítést ma már általánosan használják a fentiek helyett, különösen a genetika fokozott ismeretével. A DNS-szekvenciák összehasonlításával megállapítható, hogy mely egyedeknek van közös őse (egy olyan szervezet, amelyből az egész csoport fejlődött ki). Ez a (monofiletikus) csoport fajnak minősíthető. Ez a fajosztályozási rendszer jobb, mivel 1) alkalmazható ivartalan organizmusokra 2) felhasználható kihalt fajokra, ha rendelkezésre áll DNS 3) nem kell tesztelni a populációt, hogy kiderüljön, képesek – e keresztezni, mivel ez nagyon nehéz lehet 4) azonban szubjektív-a tudósnak el kell döntenie, hogy a közelmúltban milyen közös őst használjon (mivel minden egyénnek van közös őse az evolúció egy bizonyos pontján). Általában a populáció legújabb közös ősét használják, amely megkülönböztethető a többi populációtól.