A New Orleans Saints ninkovichot választotta az ötödik fordulóban (összesítésben a 135.) 2006-os NFL Draft.

New Orleans SaintsEdit

július 18, 2006, A New Orleans Saints aláírt Ninkovich egy hároméves, $1.22 millió szerződést.

2006edit

az edzőtábor alatt Ninkovich Charles Grant, Willie Whitehead és Eric Moore ellen versenyzett a kezdő védekezésért.

augusztus 21, 2006, A New Orleans Saints elvesztette, 30-7, a Dallas Cowboys a második előszezon játék. A játék során Ninkovich két zsákot és két kényszerű fumble-t rögzített, de felesleges érdességi büntetéssel is megjelölték, ami a Cowboys touchdownjához vezetett. Az előszezont három zsákkal fejezte be. Vezetőedző Sean Payton nevezte Ninkovich a tartalék védekező végén Will Smith és Charles Grant kezdeni az alapszakaszban.

az alapszakaszban debütált a Saints szezonnyitóján a Cleveland Browns-ban, és három kombinált szerelést rögzített a 19-14-es győzelem során. Szeptember 25-én, 2006, Ninkovich szenvedett egy szakadt MC ínszalag a térdében, miközben megjelent a speciális csapatok során a Saints 23-3 győzelem a Atlanta Falcons hétfő esti foci. Szeptember 29-én, 2006-ban a szentek Ninkovichot a szezonzáró sérült tartalékba helyezték, miután műtéten esett át a szakadt szalag javítására. Ninkovich az újonc szezonját négy kombinált szereléssel (két szóló) és egy passz elhajlással fejezte be három meccsen.

2007edit

Ninkovich kemény versenyt látott az edzőtáborban, Josh Cooper, Anton Palepoi, Jonathan Hamm és Willie Evans versenyzett.

egy délutáni gyakorlat során július 30-án, 2007-ben Ninkovichot térdsérüléssel vitték le a pályáról. Szeptember 6-án 2007-ben a New Orleans Saints lemondott a végső beosztásuk részeként.

Miami DolphinsEdit

szeptember 7-én, 2007, a Miami Dolphins azt állította, Ninkovich ki a lemondások. Cam Cameron vezetőedző Jason Taylor és Matt Roth hátvédjének nevezte.

szeptember 16, 2007, Ninkovich tette Miami Dolphins debütált során 37-20 veszteség a Dallas Cowboys. Négy meccsen inaktív volt (4-7.hét), és az egész szezonban takarékosan játszott. 2007-ben további hét meccsen inaktív volt (a 10-13.és a 14-17. héten). A 2007-es szezont két kombinált szereléssel fejezte be négy meccsen.

2008edit

vezetőedző Cam Cameront 1-15-ös szezon után menesztették 2007-ben. A Miami Dolphins felvette Tony Sparano mint új vezetőedző és védekező koordinátor Paul Pasqualoni úgy döntött, hogy a Dolphins alapvédelmét 4-3-ról 3-4-re változtatja. Ninkovich a változás miatt a külső linebackerbe költözött. Az edzőtábor alatt Charlie Anderson, Kelly Poppinga, Quentin Moses, Titus Brown és Keith Saunders ellen versenyzett a külső hátvéd szerepéért.

a Dolphins védekező végét kötötte össze Randy Starks csapatmagasságú két zsákkal a 2008-as előszezonban. Augusztus 31, 2008, a delfinek megjelent Ninkovich. Szeptember 3-án, 2008-ban aláírták a delfinek gyakorlócsapatához, miután megszüntették a lemondásokat.

November 15, 2008, Ninkovich előléptették az aktív beosztást. November 16-án tartalékos szerepben játszott az Oakland Raiders ellen, de egyetlen szerelést sem rögzített.

november 20-án, 2008-ben megjelent, hogy helyet biztosítson a linebacker Erik Walden számára. Ninkovichot másnap újra aláírták a gyakorló osztagba. A 2008-as szezont mindenféle szerelés nélkül fejezte be, és csak egy meccsen szerepelt.

visszatérés New Orleans SaintsEdit

december 3-án, 2008, A New Orleans Saints aláírt Ninkovich ki a Dolphins gyakorlat csapat. Ő megjelent július 30, 2009 után a szentek aláírt hosszú snapper Jason Kyle. Ninkovichot korábban a szentek hosszú harapási lehetőségének tekintették az offseason-ban.

New England PatriotsEdit

2009edit

augusztus 2, 2009, A New England Patriots aláírt Ninkovich egy éves, $535,000 szerződést.

bekerült a Patriots 53 fős névsorába, és az 5.héten rögzítette első NFL-zsákját a Denver Broncos ellen. Megkapta a szerződés meghosszabbítása révén a 2011-es szezonban November 6-án, 2009. Összességében 15 meccsen játszott a Patriots csapatában 2009 – ben, 23 szereléssel és egy zsákkal végzett.

2010edit

Ninkovich a 2010-es szezont kezdőként kezdte a külső linebackernél. A csapat 4.heti meccsén a Miami Dolphins ellen a Monday Night Football-on, Ninkovich rögzítette karrierje első lehallgatását, majd később a játékban újabb lehallgatást és egy zsákot adott hozzá. A szezont karrierje során 62 szereléssel, négy zsákkal és két interceptionnel fejezte be 16 lejátszott meccsen (10 rajt).

2011edit

a 2011-es NFL-szezonban Ninkovich rögzítette első NFL-touchdownját, amikor elfogott egy passzt A New York Jets hátvédjétől Mark Sanchez és 12 yardot adott vissza a touchdownért. Ugyanebben a játékban korábban volt egy másik elfogása is, amikor elkapott egy passzt Jerod Mayo. Ninkovichnak karrierje legjobb statisztikai szezonja volt, 74 szerelést, 6,5 zsákot, 2 interceptiont (1 tért vissza touchdownért), 1 kényszerített tapogatást és 3 visszanyert tapogatót rögzített, miközben mind a 16 alapszakasz-mérkőzést elindította. A Patriots 2011-2012-es rájátszási futama alatt Ninkovich 5 szerelést, 1,5 zsákot, 1 tackle-t rögzített veszteségértés 2 hátvéd találat a Broncos ellen a divíziós rájátszás során. Ninkovich hét szerelést is rögzített a Ravens ellen a második forduló konferencia bajnoki mérkőzésén. Február 5, 2012, Ninkovich játszott Super Bowl XLVI ellen A New York Giants Lucas Oil Stadion Indianapolis, Indiana, de a Patriots elvesztette a Super Bowl a Giants, 21-17. Ninkovich 4 szerelést (3 szólót), 0,5 zsákot és 2 hátvéd találatot rögzített a játékban.

2012edit

a 2012-es offseason során Ninkovich a defensive endbe költözött; a külső linebackernél a Patriots újonc volt Dont ‘ a Hightower. Ninkovich, kezdve az újonc Chandler Jones-szal, 8 zsákokkal vezette a csapatot, 58 szerelést nettósított. 5 fumble-t is kényszerített, köztük 2-t a Denver Broncos elleni meccsen, valamint egy játék véget érő hosszabbítási szalagzsákot a Jets ellen. 2012-ben minden játékot elkezdett, és 8 zsákja volt, 1 pass védett, 5 kényszerített fumbles és 4 fumble helyreállítás 58 tackle-en.

2013edit

a 3.héten a 2013-as szezon, Ninkovich aláírt egy hároméves szerződést hosszabbítás, fut át 2016, amely magában foglalta a $8.5 millió bónusz és garantált pénzt, és összesen $15 millió során. 2013-ban minden játékot elkezdett, 8 zsákot, 2 kényszerű fumbles-t és 2 fumble-helyreállítást rögzített 91 teljes szerelésnél.

2014edit

Ninkovich egyjátékos karriert állított be három zsákkal a Patriots 6.Heti játékában a Buffalo Bills ellen. A 8.héten Ninkovich visszaszerezte a Jay Cutler fumble karrierje második touchdownjáért. Ninkovich nyolc zsákkal vezette a Patriotsot, harmadik éve nyolc zsákkal. A Patriots 28-24-es győzelmében a Seattle Seahawks ellen a Super Bowl XLIX-ben Ninkovich egyszer kirúgta Russell Wilsont, és hat szerelést rögzített.

2015edit

Ninkovich mind a 16 meccset a Patriots csapatában kezdte a 2015-ös szezonban, 52 szerelést és 6,5 zsákot jegyezve.

2016edit

Ninkovich az edzőtáborban elszakította a tricepszét, és várhatóan néhány hetet kihagyott. Szeptember 2-án, 2016, Ninkovich felfüggesztették négy játék tesztelése után pozitív a tiltott anyag.

szeptember 5, 2016, A Patriots aláírt Ninkovich egy éves szerződés meghosszabbítását a 2017 szezonban.

február 5, 2017, Ninkovich része volt a Patriots csapat, amely megnyerte Super Bowl LI. A játékban két segített szerelése volt, mivel a Patriots legyőzte a Atlanta Falcons hosszabbításban 34-28-as pontszámmal. A játék utáni interjúban WBZ Sports, Ninkovich azt állította, hogy a Patriots félidőben “lerobbant” az öltözőben, utána úgy döntött, hogy “egy fene 30 perces félidőt játszik.”A Patriots a harmadik negyedben 28-3-ra elhúzott, de egészen visszaállt, hogy megnyerje a játékot 34-28-ra az Atlanta Falcons ellen. A játék volt az első, amely hosszabbításra ment, és a Patriots a Super Bowl történetének legnagyobb visszatérését érte el.

RetirementEdit

július 30, 2017, Ninkovich bejelentette visszavonulását az NFL után tizenegy szezont, köztük nyolc a Patriots.

2019 júliusában az ESPN bejelentette, hogy Ninkovich NFL elemzőként csatlakozik a hálózathoz.