1984-ben alapította a Bay Area Laboratory Co-operative-t (BALCO), egy sporttáplálkozási központot, amely először a kaliforniai Millbrae-ban található, majd később a kaliforniai Burlingame-be költözött. Az Egyesült Államok Doppingellenes Ügynöksége (USADA) szerint Patrick Arnold testépítő vegyész segítségével fejlesztette ki a tiltott szteroid tetrahidrogesztrinont (THG). Az ügyészekkel kötött vádalku alapján 2005 júliusában bűnösnek nyilvánította a szteroidok terjesztésére irányuló összeesküvés egyik számát, A másik pedig a csekk egy részének tisztára mosását. Októberben arra ítélték, hogy négy hónapot töltsön a szövetségi Taft Javítóintézetben Taft, Kalifornia, további négy pedig házi őrizetben.

2004 decemberében részt vett egy interjúban Martin Bashir az ABC 20/20 programján, ahol beismerte, hogy doppingprogramokat futtat, amelyek megdöntötték az olimpiai rekordokat, valamint feltárta, hogy: “A játékok teljes története tele van korrupcióval, eltussolással, teljesítménynövelő droghasználattal.”az interjúban többek között az ötszörös olimpiai aranyérmes Marion Jones és partnere, Tim Montgomery, Kelli White (aki később elismerte, hogy teljesítménynövelő szereket használ), a brit sportoló Dwain Chambers és az NFL játékos Bill Romanowski.

December 21-én, 2006, Yahoo Sports számolt be, hogy az egyik Conte kezdeti védőügyvédek, Troy Ellerman, már célzott az FBI, mint egy lehetséges forrása szivárog a Média során a Barry Bonds szonda. Február 14-én, 2007, Ellerman bűnösnek vallotta magát szivárgó esküdtszék vallomást. Azt is jelentették, hogy az FBI ügynökei további szivárgási forrást jelentettek.

2007 májusában Conte azt állította, hogy ismét kiegészítőket biztosít Dwayne Chambers, aki elhagyta az atlétikát, hogy játsszon a NFL Európa Liga a Hamburg Sea Devils mielőtt 2008-ban visszatért az atlétikához. Conte szerint ezek a táplálékkiegészítők, amelyeket a Scientific Nutrition for Advanced Conditioning cégén keresztül biztosítanak, teljesen legálisak.

December 13-án, 2007 Conte megjelent a CNN előtt a Mitchell-jelentés hivatalosan is megjelent.