ある日、同僚が私の作業台に立ち寄って、どの洗剤が核膜を壊さないか尋ねました。 溶解緩衝液に優しい洗剤を使用した私の以前の経験に基づいて、私は”NP-40″と答えました。 しかし、私たちはNP-40の二つのブランドを持っていました。 データシートを詳しく見ると、同じ頭字語を使用していても化学名が異なることが明らかになりました。

他の名前の洗剤は甘いように溶解しますか？すべてのNP-40が似ているわけではないことがわかった後、私は同僚の驚いた表情を共有しました。

私たちはすべてのNP-40が似ているわけでは しかし、それは違いを生むだろうか？ 一般に、哺乳動物細胞は、ＲＩＰＡ緩衝液などの緩衝液を用いてタンパク質抽出のために溶解することができる。 通常、RIPAの緩衝は全細胞小器官を分けるNP-40のような非イオンの洗剤を含んでいます。 利用可能な他の非イオン性洗剤には、Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ−１ ０ ０、Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ−１ １ ４、およびＴｗｅｅｎ−２ ０が含まれる。 細胞の種類と用途に応じて、使用する洗剤の濃度（一般的に0.1–2％）は、細胞質の内容物と核の内容物が互いに汚染する可能性があります。 あなたの目的が西部のしみによって全細胞の溶解物のあなたの好みの蛋白質を検出することなら洗剤のより高い濃度は好ましいです。 しかし、私の同僚は細胞内の分画、特に核抽出を行いたかったのです。 これらの試料の調製は、最初の溶解ステップにおける膜の破壊を最小限に抑えるために、はるかに低い濃度の洗剤を必要とする傾向がある。私の同僚への私の応答のエラーは、私が細胞溶解の望ましい結果を完全に考慮していないということでした。

私の同僚への応答のエラーは、私が 彼らは、細胞全体におけるタンパク質の存在量を決定するだけでなく、タンパク質の局在を評価したいと考えていました。 それでも…NP-40は仕事のための正しい洗剤でしたか？

頭字語”NP-40″は、次のIUPAC名の二つの化学物質を参照することができることが判明しました。

• Octylphenoxypolyethoxyethanol:street name IGEPAL™
• Nonylphenoxypolyethoxyethanol:street name Tergitol™

アルキル基の数（太字）にある二つの化学物質の間に一つだけの違いがあることは注目に値する。 これにもかかわらず、彼らの通りの名前の違いは、両方のボトルは単に”NP-40″と言います。

名前の中には何がありますか？

とらえどころのない用語”NP-40″の起源に関する研究を行った後、私は現在の市販のNP-40ブランドは、しばしばNP-40と略される廃止されたシェルケミカルカンパニーのNonidet P-40の代用品と考えられていることを発見しました。 シェルのNonidet P-40の廃止後、Sigma-AldrichやPanReac AppliChemのような他の企業は、「Nonidet P-40代替品」と呼ばれるものを配布し始めました。 二つの主要な商標名が登場しました: IGEPAL™およびTergitol™。 IGEPALおよび貝のNonidet P-40にoctylphenoxypolyethoxyethanolの化学名前があるので、IGEPALは中断された洗剤に最も化学的に類似しています。あなたの武器のすべての背景知識で、それは私の同僚の質問に戻っています。

あなたの武器のすべての背景知識で、それは私の同僚の質問に戻りま 一般に、細胞内分画は、0.1％のNonidet P-40（私は0.05％が出版物で報告されているのを見てきました）の洗剤濃度を必要とし、これはIGEPAL、Tergitol、または他のNonidet P-40代替物のいず だから、私の同僚の質問に答えるためのより良い方法は、「0.1％のNonidet P-40から始めることをお勧めします。”. 私はまた、彼女が再現性の目的のために使用することを決定したNonidet P-40のブランドを文書化することをお勧めします。 特定のブランドに注意する経験的データがあります。 そのような出版物の一つは、洗剤効力を決定するために、中止されたブランドを含む異なるブランドのNonidet P-40を含む緩衝液中の重合チューブリンの収率を比較するために時間を要していた。 ネタバレ注意: Nonidet P-40の現在のブランドは中断されたブランドより重合させたtubulinの隔離で有効である!

名前の混乱：化学者にそれを責める！この逸話は、実験室の試薬の名前が心を悩ます可能性のある別の例を思い出しました。

この逸話は、実験室の試薬の名前が心を悩ます可能性のあ 細胞溶解の話題に続いて、プロテアーゼとプロテイナーゼの違いは何ですか？ “NP-40″の場合と同様に、”プロテイナーゼ”という用語の背後にある物語は、文献の混乱につながっているだけです。 プロテイナーゼKを聞いたことがありますか？ プロテイナーゼKの一般的な用途はDNA抽出である。 なぜプロテアーゼKと呼ばれていないのですか？ 生化学ジャーナルからの1986年の手紙に従って、”プロテアーゼ”は蛋白質の背骨を構成するペプチッド結合の開裂のためのより広い言葉です。 しかし、プロテアーゼは、短い二次構造/ペプチドだけでなく、三次構造/タンパク質を切断することができます(think Biochemistry101)。 したがって、”プロテイナーゼ”という用語は、三次構造タンパク質を切断するプロテアーゼを同定する方法として浮上した。 しかし、現在の研究室では、例えばプロテイナーゼKを除いてプロテアーゼについて話す傾向がある。 あなたが”プロテアーゼK”と言った場合、あなたは正しいでしょうが、あなたはどの目録でもそれを見つけるのが難しいかもしれません。だから、本当のNP-40は立ち上がるのだろうか？ Eminemはnonidet P-40またはIGEPALの廃止されたShell Chemical Companyブランドのいずれかを探しているように見えます。 ただし、特定のアプリケーションでは、使用したいNP-40のブランドに関するより経験的なデータを収集する価値があります。 個人的には、私は”NP-40″を正当な”Nonidet P-40″に置き換えるために私たちの語彙から排除することを好むだろうが、ここでは”トマト”または”トマト”だと思います！

1. Sinka S,Field JJ,Miller JH(2017). 微小管ターゲティング剤をスクリーニングするための細胞内チューブリン重合アッセイにおける代替ノニデットP-40非イオン洗剤の使用。 セルバイオール 95: 379-384.
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