覚醒は、脳幹に発生し、中脳、視床下部、視床および基底前脳を通って上昇する複数の神経伝達 後部の視床下部はwakefulnessの根底にある皮層の活発化の維持の重要な役割を担います。 脳のこの部分に由来するいくつかのシステムは、覚醒から睡眠への移行を制御し、睡眠から覚醒への移行を制御する。 ヒスタミンニューロンtuberomammillary核および近くの隣接した後部の視床下部のプロジェクト全体の頭脳にあり、頭脳で今までに識別される最も航跡選択的なシステ もう一つの重要なシステムは、ニューロンを投影するオレキシン（hypocretinsとしても知られている）によって提供されるものである。 これらはヒスタミンニューロンに隣接する領域に存在し、それらのようにほとんどの脳領域に広く投影され、覚醒に関連する。 オレキシン欠乏症はナルコレプシーの原因として同定されている。

研究は、オレキシンとヒスタミンニューロンが認知と皮質脳波の活性化と覚醒行動とヒスタミンとより関与しているオレキシンと覚醒を制御

胎児は起きていないことが示唆されており、生まれたストレスとそれに関連するコエルレウス座の活性化のために新生児に覚醒が起こる。