Oncomine
Oncomineは、固形腫瘍における143個のがん関連遺伝子（>2,500アンプリコン）のDNAおよびRNAから、臨床的に重要な体細胞変異（SNVs）、挿入および欠失（Indels）、遺伝子融合およびコピー数変化（CNAs）を含む臨床的に重要な体細胞変異を同定するための標的試験であり、標的化された次世代シーケンシング（NGS）を用いている。 アッセイで尋問された遺伝子は、ゲノム変化によって73のホットスポット遺伝子（SnvおよびIndelsを有する）に分類され、ERBB2などの焦点Cnaを有する49遺伝子、およびNSCLC中のALKおよびROS1などの既知の融合を有する23遺伝子を含む。 この試験はまた、ＡＬＫ、ＲＯＳ１、ＲＥＴおよびＮＴＲＫ１についての４組の５’、３’発現不均衡アッセイを含む。 さらに、テストは26の腫瘍のサプレッサーの遺伝子の完全な適用範囲を提供します。Oncomine Comprehensiveパネルは、NTRK1、NTRK2、およびNTRK3融合を検出することができます。 このタイプの融合の患者はlarotrectinib、トロポミオシンの受容器のキナーゼ(TRK)の融合癌のための最近承認されたFDAの処置のために資格があるかもしれません。
Oncomineファクトシート
Oncomine FAQ
標本要件
- ホルマリン固定パラフィン埋め込み（FFPE）標本
- One H&Eスライドと15-20の未染色セクションが必要です
- 許容可能な腫瘍性細胞性の最小量は20％です
- 固定細針吸引（Fna）標本
- one h&eスライドと細胞ブロックからの15-20の染色されていないセクションが必要です
- 許容可能な腫瘍性細胞性の最小量は20％である
- cytolyt溶液
- CytoLytまたはPreservCyt溶液に懸濁した細胞
- 室温で8日以内に保存
テストの注文
Oncomine Comprehensive Mutation PanelはEpicで利用可能であり、腫瘍医が注文することができます。 病理学者または細胞病理学者は、CoPathを通じて直接検査を注文することもできます。
免責事項
Oncomine包括的なテストが開発され、その性能特性は、Weill Cornell Medicine/New York-Presbyterian HospitalのEnglander Institute for Precision Medicine/Department of Pathology and Laboratory Medicineによって決定され、New York-State Department of Health（NYS-DOH）によって承認されました。 この方法は、食品医薬品局（FDA）によってクリアされていません。 FDAは、そのようなクリアランスまたは承認が必要ではないと判断しました。
不確かな起源の変異体（生殖系列対体細胞起源）は、生殖系列の変化が報告されていないように、この試験で明確に決定することはできません。
不確か 可能性のある病原性生殖系列変異（遺伝性）が疑われる場合は、理事会認定遺伝カウンセラーによるカウンセリングが推奨されます。