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ピコルナウイルス、急性呼吸器疾患で入院したすべての年齢の患者の間で感染を引き起こす最も一般的な呼吸器ウイルス | Company Pride

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下気道感染症は、米国における感染症関連の入院の主要な原因である(13)。 我々は以前に入院(につながる急性気道条件に関連付けられている特定のウイルス感染の頻度を決定した5)。 この研究に登録された患者は公立または私立の病院に入院し、呼吸器ウイルス感染は細胞培養および血清学的研究によって同定された。 呼吸器疾患に関連する呼吸器ウイルス感染の数は、逆転写PCR(RT-PCR)アッセイ(3、6)の適用によって増加させることができるので、我々は、追加の呼吸器ウイ

臨床試験の詳細は以前に記載されています(5)。 簡単に言えば、研究参加者は、急性呼吸器疾患(肺炎、気管気管支炎、細気管支炎、クループ、喘息または慢性閉塞性肺疾患の悪化、またはうっ血性心不全)を伴う、テキサス州ヒューストンのBen Taub General HospitalまたはSt.Luke’s Episcopal Hospitalに入院したすべての年齢の人であった。 呼吸器サンプル(鼻洗浄または喉スワブ)および血清サンプルは、入院の1日の中央値以内に収集された。 このサブスタディは、1月の1993年から1995年の研究の終わりまで登録された参加者に対して実施された。 呼吸試料を回収時に安定剤として仔牛注入ブロスと混合し、湿った氷上で実験室に輸送し、細胞培養物に接種した。 分子アッセイ(以下に記載)を用いて試験するまで、残りの試料を分注し、−7 0℃で凍結した。 一般に、試料は、最初の試験のためにcDNAを生成するために、1つまたは2つの凍結融解を受けた。 回復期血清サンプルは14-42日後に得られた。 すべての被験者は、Baylor College Of Medicine Institutional Review Boardによって承認されたプロトコルの下でインフォームドコンセントを提供した。細胞培養および血清学に使用される方法は、以前に記載された(5)。

細胞培養および血清学に使用される方法は、以前に記載された。 細胞培養アッセイは、A型およびB型インフルエンザウイルス、パラインフルエンザウイルス(PIV)1型から3型、呼吸合胞体ウイルス(RSV)、ライノウイルス、エンテロウイルス、ヘルペスウイルス、およびアデノウイルスについて試験した。 血清学的アッセイは、インフルエンザAおよびBウイルス、PIVタイプ1から3、RSV、およびコロナウイルス229EおよびOC43の対になった血清サンプルについRT-PCRアッセイは、インフルエンザAおよびBウイルスおよびコロナウイルスOC43および229E(3)のための前述のリアルタイムRT-PCRアッセイを使用して行 PIV型1〜3(それぞれPIV1、PIV2、およびPIV3)、RSV、ヒトメタニューモウイルス(HMPV)、およびピコルナウイルス感染を、前述のRT−PCRアッセイを用いて同定し、続いてサザンブロットハイブリダイゼーション(3)を行った。 ピコルナウイルス陽性試料は、これらのアッセイのために十分なサンプルが残ったときに、ライノウイルスおよびエンテロウイルス特異的リアルタイムRT-PCRアッセイを用いてさらに分類された(8、11)。

合計403の別々の病気が2年間の研究期間中に364人で発生しました。 七十から六呼吸器ウイルス(単純ヘルペスウイルスとサイトメガロウイルスを除く)は、研究期間中に収集された75の病気の標本から単離された。 これらには、2 6個のピコルナウイルス、2 1個のRSV、1 9個のインフルエンザウイルス、4個のアデノウイルス、及びPIV1、PIV2、及びPIV3の各々2個が含まれた(表1)。 三十の病気(テストされた136対の血清の)も血清学によって同定された33の感染症を持っていた、11の培養によって同定された(6インフルエンザaサブタイ 血清学によって同定されたが、培養によって同定されなかった追加の感染には、七つのA/H3N2、RSV、PIV2、PIV3、およびOC43のそれぞれ三つ、およびA/H1N1、PIV1、および229Eのそれぞれ一つが含まれていた。

表1

403の病気のコホートにおける培養またはRT-PCRによって同定された感染症は、1993年から1995年の間に評価された403の病気のコホートにおいて、1993年から1995年の間に評価された感染症である。

6

51

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d rowspan=”1″16

virusa 合計いいえ。 感染の いいえ。 感染症の: TR>
PCR陽性 PCR陰性またはNDb
培養陽性 培養陰性 培養陰性 培養陰性 培養陰性 培養陰性 培養陰性 “1”>カルチャ陽性
ピコルナウイルス td> 5 3 2 0
ライノウイルス ライノウイルス ライノウイルス ライノウイルス ライノウイルス ライノウイルス
未分類 14 29 6
未分類 14 29 6
6 51 3
パラミキソウイルス 1″COLSPAN=”1″>
PIV1 PIV1 PIV1 PIV1 PIV1 PIV1 1″>3 2 1 0
piv2 2 2 2 2 2 2 0 0 2
piv3 6 6 6 6 6 6
RSV RSV RSV RSV RSV RSV RSV RSV RSV RSV 15 5
hmpv 12 12 12 12 12 12 12 12 0
オルソミキソウイルス オルソミキソウイルス オルソミキソウイルス オルソミキソウイルス オルソミキソウイルス /td>
インフルエンザA 21 8 8 8 8 8 8 5 8
インフルエンザb 3 1 1 1 1 1 1 コロナウイルス コロナウイルス コロナウイルス コロナウイルス コロナウイルス コロナウイルス コロナウイルス コロナウイルス
OC43 5 td> 5 0
229e 2 0 0 0 0 0 0 2 0
アデノウイルス* 4 アデノウイルス* 4 4 4 4 /td> 4
ヘルペスウイルス td> hsv* 13 13 13 13 13 13 13 13 13 cmv* cmv* cmv* cmv* cmv* cmv* cmv* cmv* colspan=”1″> 3
aPIV、パラインフルエンザウイルス;RSV、呼吸器合胞体ウイルス;HMPV、ヒトメタニューモウイルス;HSV、単純ヘルペスウイルス;cmv、サイトメガロウイルス。 *、PCRは行われません。 培養系は、最初の研究の時点では、OC43またはHMPVには利用できなかった。 その後、RT−PCRによってHMPV陽性の標本を細胞培養によって試験し、1は陽性であった。
bND、PCRは行われていません。

8%)は、分子試験のために利用可能であった。 百七十から二(44.6%)のサンプルは、同定された最も一般的な感染であるピコルナウイルス(n=99)で、アッセイされたウイルスの少なくとも一つ(表1)について陽性 RT-PCRアッセイを行ったすべてのウイルスはPIV2を除いて検出された;piv2感染はRT-PCRによって同定されなかったが、二つの感染は細胞培養を用いて見つ 全体として、403の病気の200(49.6%)は、少なくとも1つのウイルス感染と関連していました。 複数のウイルス感染は33の病気(31つの感染症と2つの感染症)で同定された。 複数の感染の二十から二は、ピコルナウイルスが含まれており、ピコルナウイルスとRSVが最も一般的な組み合わせ(n=10)であり、RSVとインフルエンザaウイルスとの二重感染が3つの病気で検出された。 別の呼吸器ウイルスは、CMVが単離されたすべての三つの病気とHSVが単離された6の11の病気で同定された。

ウイルス感染は、77.6歳未満の子供の5%で同定された(表2)。 高齢の子供は病気の50%以上で特定された感染症を有し、成人は病気の約3分の1で特定された感染症を有していた。 複数の感染症は、1歳未満の小児で最も頻繁に同定された。

表2

年齢別呼吸器ウイルス感染の分布(培養、PCR、血清学の組み合わせ結果)

ライノウイルス

2

mpv

コロナウイルス

ヘルペスウイルス

43

Virusa いいえ。 各年齢グループの感染のうち(yrs)(n)
<1(55) 1-4 (57) 5-17 (50) 18-44 (65) 45-64 (114) ≥65 (62) すべての年齢(403)
ピコルナウイルス ピコルナウイルス
エンテロウイルス
エンテロウイルス
エンテロウイルス
エンテロウイルス 3 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 15 6 ライノウイルス ライノウイルス ライノウイルス ライノウイルス ライノウイルス ライノウイルス 8 8 9 3 49
49
49
49
49
13 11 17 6 5 5 6 6 5 6 6 2 54
パラミクソウイルス パラミクソウイルス パラミクソウイルス パラミクソウイルス パラミクソウイルス パラミクソウイルス パラミクソウイルス 1″colspan=”1″>
1″colspan=”1″>0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 3
piv2 2 3 3 3 3 3 3 0 0 0 0 0 0 5
1″colspan=”1″>0 0 0 2 2 3 3 3 3 3 3 15 14 9
rsv 15 14 15 15 15 14 2 39
39
39
39
39
39
39
2 4 0 2 2 2 2 2 2 2 2 12
オルソミキソウイルス オルソミキソウイルス
インフルエンザA
インフルエンザA
0 4 2 6 11 11 11 11 11 11 1″colspan=”1″>26
インフルエンザb 0 2 2 2 2 2 2 0 0 0 0 1 3
3
3
3
3
/td> oc43 0 0 0 0 0 0 0 0 1″colspan=”1″>0 1 6 0 7
6 7
7
7
0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 2 3
アデノウイルス アデノウイルス 1 1 1 1 1 1 0 1 1 1 0 4
4
4
4
4 hsv hsv hsv hsv hsv hsv hsv hsv hsv hsv 13
2 6 4 13
13
13
13
13
cmv 2 0 0 1 0 0 0 0 0 0 44 44 44 44 44 44 44 44 44 24 42 16 200
200
24 24 24 24 24 複数のウイルス 11 7 4 4 4 3 3 3 3 3 4 33
apiv、パラインフルエンザウイルス; RSV、呼吸器合胞体ウイルス;HMPV、ヒトメタニューモウイルス;HSV、単純ヘルペスウイルス;CMV、サイトメガロウイルス。
bこのカテゴリは、少なくとも一つのウイルスを持つ人に対応しています。呼吸器ウイルス感染の診断への分子法の適用は、喘息(1、6)、慢性閉塞性肺疾患(3、12)、および細気管支炎(4、10)の悪化を有する患者および一般的な呼吸器ウイ 我々は以前に伝統的な(文化と血清学)ウイルス診断法を使用してコミュニティコホートに呼吸器ウイルス感染の影響を調べる疫学的研究を行った。 その研究で収集された標本へのRT-PCRアッセイの適用は、細胞培養物のそれと比較していくつかのウイルス(例えば、ピコルナウイルス)のアッセイの感度の増加、および不十分または栽培できない他のウイルス(例えば、HMPVおよびコロナウイルス)を同定する能力のために、約2倍によって同定されたウイルス感染の数を増加させた。

検出頻度が最も高いウイルスのファミリーは、ピコルナウイルス(エンテロウイルスおよびライノウイルス種)であり、病気のエピソードの約25%で同定され 使用されたライノウイルスおよびエンテロウイルス特異的プライマーは、ライノウイルスおよびエンテロウイルスのすべての種に対して検証されていないため、追加の検出されないピコルナウイルス感染が見逃されている可能性がある。 分子試金を使用してpicornavirusの伝染の高められた同一証明は子供の他の調査の調査結果と調和して5歳以下および喘息、COPDおよび細気管支炎の患者です(1, 6, 7, 10, 12).

要約すると、分子診断アッセイの使用は、急性呼吸器状態の急性ケア病院に入院した人における呼吸器ウイルス感染の同定の頻度を増加させた。 このコホートでは、成人の病気の25〜37%と比較して、5歳未満の小児の呼吸器疾患の75%以上が呼吸器ウイルスの検出と関連していた。 呼吸器ウイルス感染の有病率は、NL63またはHKU1コロナウイルスまたはPIVタイプ4のアッセイを行っていないため、さらに高かった可能性があります。 ピコルナウイルス(主にライノウイルス)感染症は、RSVおよびインフルエンザウイルスによって引き起こされるものに続いて、すべての年齢の患者で同定された最も一般的な感染症であった。 分子アッセイの使用は、細胞培養および血清学の古典的なウイルス診断法のそれと比較して、呼吸器ウイルス感染を同定する頻度を増加させる。