DetmerはBYUに通い、1987年から1991年までbyuクーガーズのサッカーチームでプレーした。 どの大学に進学するかを決める際に、彼はBYUのアルコールフリーの環境に惹かれた部分がありました。 1987年シーズンにクーガーズに移籍し、1988年にショーン-コヴィーとレッドシャツのフレッシュマンとしてクォーターバックの任務を分担した。 この年は1試合しか出場しなかったが、ニューメキシコ戦ではパス333ヤード、5タッチダウンをあげて65-0で勝利した。 その後、1988年のフリーダムボウルで最も価値のある選手に選ばれ、代役として試合に出場し、コロラド-バファローズに20-17で勝利した。

Detmerは1989年にフルタイムのスターターになりました。 レギュラーシーズンではパス4,560ヤード、32タッチダウンをあげ、全米トップのクォーターバックの一人となった。 175.6という彼のパサーの評価はNCAAをリードし、彼はヒューストンのアンドレ-ウェアに次ぐオールオフェンスで終わった。 彼はByuをWestern Athletic Conference（WAC）選手権に導き、1985年以来のチーム初の優勝を果たしました。 デトマーは1989年のホリデーボウルでペンシルベニア州立大学と対戦し、1回のボウルゲームでパスヤード最多（576ヤード）、トータルオフェンス最多（594ヤード）のNCAA記録を樹立してシーズンを終えた。 彼はハイズマン・トロフィーの投票で9位に終わった。

Detmerの1990年のジュニアシーズンは、カレッジフットボールの歴史の中でクォーターバックのための最大のシーズンの一つとしてランク付けされています。 レギュラーシーズン12試合でパス5,188ヤード、41タッチダウンをあげ、NCAA記録42ヤードを獲得した（他の5試合ではタイ記録）。 このシーズンのハイポイントはマイアミ・ハリケーンズに28-21で勝利したことであり、デトマーはクーガーズを406ヤードのパスでリードした。 そのシーズンのパフォーマンスで、彼はハイズマントロフィーだけでなく、マクスウェルとデイビー*オブライエン賞を含む他の多くの名誉を授与されました。 Ap通信、Upi、新聞企業協会、アメリカサッカー作家協会、ウォルター・キャンプ財団、フットボール・ニューズ、スクリップス・ハワード、スポーツ・ニューズのファーストチームに選出されたことで、オールアメリカンのコンセンサス・ファーストチームとして認められた。 クーガーズはハワイとの最後のレギュラーシーズンの試合で59-28で敗れ、テキサスA&Mに65-14で敗れた1990年のホリデーボウルであった。 Detmerはテキサスaとの試合からノックアウトされました&M、オフシーズンの手術を必要とする二つの別々の肩に苦しんでいました。

1991年シーズンはByuのために悪いスタートを切った,クーガーズは、彼らの最初の三つのゲームを失ったとして(#1フロリダ州とのニュートラルフィールドと#23UCLAと#12ペン 0-3の判定負けを喫し、王座獲得に失敗した。 クーガーズは8連勝し、レギュラーシーズン最後のロードゲームでサンディエゴ・ステートと52-52の同点で3年連続WACチャンピオンシップをクリンチした。 その試合では、ByuはDetmerがカムバックを導いた前に45-17の後ろに落ちた。 この試合ではパス599ヤード、6タッチダウンを記録し、キャリアハイの成績を残した。 クーガーとしての最後の試合では、デトマーは350ヤードをパスし、13-13の同点で7位のアイオワと1991年のホリデーボウルに出場した。 この年のレギュラーシーズンではパス4,031ヤード、35タッチダウンをあげた。 彼はハイズマン・トロフィーの投票で3位に終わったが、デイビー・オブライエン賞を再び獲得し、サミー・ボー・トロフィーと今日のトップVI賞も獲得した。 さらに、彼は再びコンセンサスファーストチームのオールアメリカンとして認識されました。パス1,530回、958回、15,031回、121回のタッチダウンパス、14,665回の総攻撃、135回のタッチダウン、162.7回のパサー—レーティングで当時のNCAA記録を更新した。 大学でのキャリアは59のNCAA記録を達成し、他の3つの記録を達成しました。 Byuではパス16,206ヤード、タッチダウンパス127タッチダウンパスを記録した。 彼はレクリエーション管理の学士号を取得して卒業しました。 2012年、デトマーはカレッジフットボールの殿堂入りを果たした。