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VUS-遺伝子検査で最も悪意のある結果|青写真遺伝学

不確実な意義の変異体(VUS)は、多くの場合、課題として見られている遺伝子検査の側面です。 どのように私は私の患者にこの結果を説明するのですか? この結果は、私が患者を管理する方法を変更しますか? 上級遺伝学者のJennifer Schleitは、なぜ変異体がVUに分類されるのか、そして再分類を進めるために何ができるのかを説明しました。VUSの場合はどうなりますか?

ACMGガイドラインに基づく遺伝的変異体の分類は、通常、病原性、病原性の可能性が高い、不確実な有意性の変異体(VUS)、良性の可能性が高い、または良性の変異体を分類するために必要な証拠の量と質を記述する五段階のスキームである。 変異体の分類がVUSである場合、それは、解釈の時点で、変異体が疾患に関連しているかどうかを決定するのに十分な証拠がなかったことを意味する。

“問題の変異体はまれである可能性がありますが、影響を受けた個体では同定されていません。 または、同定された変異体は、その遺伝子について知られているものとは異なる機構であってもよい。 例えば、機能の増加のみが報告されている遺伝子の欠失。 したがって、問題の変種が臨床的意義を持っているかどうかはわかりません”とSchleit氏は述べています。

変異体が病気に罹患している個体で報告されているが、変異体が多数の健康な対照個体でも見られる場合、これが変異体の浸透度の低下を表すかどうか、または変異体が臨床遺伝子検査で同定されており、表現型に誤って起因している一般的な良性変異体であるかどうかを判断することは困難であることが多い。

「ACMGガイドラインによれば、vuは臨床的意思決定に使用すべきではありません。 患者がVUを有すると同定された場合、すべての臨床的決定は、VUの存在ではなく、個人および家族歴に基づいて行われるべきである」とSchleitは強調した。

Schleitはさらに、ACMGは、これらの変異体の再分類を可能にする可能性のある追加の証拠を生成するためにフォローアップテストを追求することを推奨

“私たちは今、バリアントの臨床的意義を理解していないかもしれませんが、バリアントが患者の説明であるという非常に現実的な可能性があ”

再分類を支援するにはどうすればよいですか?

時間の経過とともに、より多くの証拠が利用可能になるにつれて、変異体を再分類することができます。

“類似の表現型を有する患者は、その同じ変異体で同定することができる。 これは、再分類をサポートするために使用できる追加の証拠になるだろう”とSchleit氏は述べた。

さらに、家族分離研究は、再分類を支持する証拠を提供する可能性がある。

“また、以前にテストされていない民族や地理的集団からの正常なコホートの配列決定、機能研究の完了、または同じタイプの追加の変異体が発見され

Schleitは、再分類は実験室と臨床医の間の共同プロセスであると述べた。

“まず、詳細な表現型情報や関連する家族の病歴を含む患者に関する臨床情報は、臨床的解釈にとって非常に重要です”とSchleit氏は述べています。

“家族歴を見て、分離研究が有益であるかどうかを確認することは有益です。 家族歴はその遺伝子の継承タイプと一致していますか? テストすることができる他の影響を受け、影響を受けていない家族がありますか?、”シュライト”が掲載されています。また、遠くに関連する影響を受けた個人は本当に強力な証拠を提供することができます。

あなたがいとこである個人を持っていて、表現型の2人の個人の間に分離があることを示すことができるならば。しかし、家族研究を検討する際に心に留めておくべき重要なことは、病気の発症年齢です。

しかし、家族研究を検討する際に重要なことは、病気の発

“たとえば、あなたの患者が40代や50代などの後に現れる後発の病気を持っている場合、そのような状況では、若い家族をテストすることは有用ではありません。 研究室では、これらの若い家族のVUSを識別することができますが、彼らは表現型を開発するかどうかを言うには若すぎるかもしれません。 このような状況では、若い家族をテストすることは、再分類の証拠を提供しません”とSchleitは説明しました。

場合によっては、遺伝子自体について十分な情報が知られていないことがあります。 「不確実な意義の遺伝子は、疾患遺伝子の関連性を示すためにさらに多くの証拠を必要とする。 これは、追加の家族や機能的研究などから来ることができます。”Schleitは続けましたが、多くの場合、再分類はまだ不可能であることを強調しました。

“時には、それはちょうど待っているの問題かもしれません。 時間とともに、再分類をサポートする新しい証拠が発見される可能性があります。”

遺伝コミュニティへの再分類の具体的な利点: “報告の透明性は非常に重要である”

蓄積する知識のためには、学界、医療機関、産業界が協力し、遺伝子データを報告し、機能研究を完了させるためにチームを組むことが重要である。 SchleitはJPH2遺伝子からの例を与える。 この遺伝子の変異体は、心臓疾患における遺伝子の役割の理解が不十分であるため、しばしばVUSsとして分類された。 六つの家族における肥大性心筋症とJPH2変異体の分離を記述する最近の報告は、現在、変異体はVUSから可能性が高い病原性に、さらに、病原性に再分類す 1

“Vanninenらによる研究では。、患者ケア、研究および診断実験室間の共同は彼らの遺伝子検査の結果と結合されるべき患者およびその家族の臨床病歴の詳細な分析を可能にした。”

結論として、Schleitは、報告の透明性が再分類を可能にするために非常に重要であると感じました。

“ラボは、報告された変異体を分類するために使用されたすべての証拠、または試験に含まれる可能性のある技術的制限を概説する詳細な解釈を提 そうすれば、変異体または遺伝子の新しい関連出版物に目を光らせたり、その遺伝子または障害を研究している研究者に連絡したりする方が簡単です」とSchleit氏は述べています。

運が良ければ、そのような共同研究はさらに、臨床的に影響を与える研究につながる可能性があります。