pojęcie gatunku biologicznego klasyfikuje gatunki jako grupę faktycznie lub potencjalnie krzyżujących się osobników. Oznacza to, że dowolne dwa osobniki (no samiec i samica) w grupie mogą rozmnażać się i produkować płodne potomstwo. Ta definicja jest powszechnie używana, ale są z nią pewne problemy i sytuacje, w których nie można jej użyć. 1) nie wszystkie gatunki rozmnażają się płciowo 2) nie można go zastosować do zapisu kopalnego podejście filogenetyczne jest obecnie powszechnie stosowane zamiast powyższego, zwłaszcza przy zwiększonej wiedzy o genetyce. Porównując sekwencje DNA można stwierdzić, które osobniki mają wspólnego przodka (organizm, z którego wyewoluowała cała grupa). Tę (monofiletyczną) grupę można zaklasyfikować jako gatunek. Ten system klasyfikacji gatunków jest lepszy, ponieważ 1) może być stosowany do organizmów bezpłciowych 2) może być stosowany do wymarłych gatunków, jeśli dostępne jest DNA 3) nie ma potrzeby testowania populacji, aby sprawdzić, czy mogą się krzyżować, ponieważ może to być bardzo trudne 4) jest to jednak subiektywne – naukowiec musi zdecydować, jak niedawno użyć wspólnego przodka (ponieważ wszystkie osobniki mają wspólnego przodka w pewnym momencie ewolucji). Zwykle używany jest ostatni wspólny przodek populacji, który można odróżnić od innych populacji.