Narodziny tragedii były gniewnie krytykowane przez wielu szanowanych zawodowych badaczy literatury greckiej. Szczególnie gwałtowny był filolog Ulrich von Wilamowitz-Moellendorff, który potępił twórczość Nietzschego jako lekkomyślną i wprowadzającą w błąd. Zainspirowany przez Nietzschego, Erwin Rohde-przyjaciel, który napisał pozytywną recenzję, która wywołała pierwszą obraźliwą debatę nad książką-odpowiedział, ujawniając niedokładne cytaty Wilamowitza-Moellendorfa o twórczości Nietzschego. Richard Wagner również wydał odpowiedź na krytykę Wilamowitza-Moellendorfa, ale jego działanie służyło jedynie scharakteryzowaniu Nietzschego jako lokaja kompozytora.

w swoim potępieniu narodzin tragedii Wilamowitz mówi:

Herr N. … jest również profesorem filologii klasycznej; zajmuje się szeregiem bardzo ważnych zagadnień z historii literatury greckiej. … To jest to, co chcę oświecić i łatwo udowodnić, że tutaj również wyimaginowany geniusz i bezczelność w przedstawianiu jego twierdzeń stoją w bezpośrednim związku z jego ignorancją i brakiem miłości do prawdy. … Jego rozwiązaniem jest bagatelizowanie metody historyczno-krytycznej, karcenie wszelkich odmiennych od jego własnych poglądów estetycznych i przypisywanie „kompletnego niezrozumienia badań nad starożytnością” epoce, w której filologia w Niemczech, zwłaszcza dzięki pracom Gottfrieda Hermanna i Karla Lachmanna, została podniesiona do bezprecedensowego poziomu.

sugerując, że Grecy mogli mieć problemy, Nietzsche odchodził od tradycji naukowych swojej epoki, która postrzegała Greków jako szczęśliwych, być może nawet naiwnych i prostych ludzi. Praca jest siecią profesjonalnej Filologii, wnikliwości filozoficznej i podziwu dla sztuki muzycznej. Jako praca Filologiczna została niemal natychmiast odrzucona, praktycznie niszcząc akademickie aspiracje Nietzschego. Temat muzyczny był tak ściśle związany z Richardem Wagnerem, że stał się wstydem dla Nietzschego, gdy on sam osiągnął pewien dystans i niezależność od Wagnera. Jest zatem pierwszym kompletnym, opublikowanym dziełem filozoficznym Nietzschego, w którym zadaje się zbiór pytań, w sposób szkicowy identyfikuje się je i na nie odpowiada.

Marianne Cowan we wstępie do filozofii Nietzschego w tragicznym wieku Greków opisuje sytuację tymi słowami:

Narodziny tragedii przedstawiały pogląd Greków tak obcy duchowi tamtych czasów i ideałom jego nauki, że zniszczył całą karierę akademicką Nietzschego. Sprowokowało to broszury i kontr-broszury atakujące go ze względów zdrowego rozsądku, nauki i rozsądku. Przez pewien czas Nietzsche, wówczas profesor filologii klasycznej na Uniwersytecie w Bazylei, nie miał studentów w swojej dziedzinie. Jego wykłady były sabotowane przez niemieckich profesorów filozofii, którzy radzili swoim studentom, aby nie pojawiali się na kursach Nietzschego.

w 1886 roku sam Nietzsche miał zastrzeżenia do dzieła i opublikował przedmowę w wydaniu z 1886 roku, w której ponownie ocenił niektóre z jego głównych obaw i idei w tekście. W tym post-scenariuszu Nietzsche określił Narodziny tragedii jako ” książkę niemożliwą… źle napisany, ponury, żenujący, obraz-szalony i obraz-zdezorientowany, sentymentalny, sacharynowy do punktu zniewieściałości, nierówny w tempie, bez woli do logicznej czystości.”Mimo to bronił” aroganckiej i rapsodycznej książki „za inspirowanie” kolegów rapsodystów „i za zwabianie ich na” nowe sekretne ścieżki i miejsca tańca.”

w 1888 roku, w Ecce Homo, Nietzsche wrócił do ataku. Broni narodzin tragedii, stwierdzając: „… jest obojętne wobec polityki,-’ nie-Niemieckie’, posługiwać się językiem współczesnym-pachnie obraźliwie Heglowskim, a trupie Perfumy Schopenhauera trzymają się tylko kilku formuł. „Idea” – antyteza Dionizyjska i Apollińska-przełożona na metafizyczną; historia sama w sobie jako rozwój tej „idei”; w tragedii ta antyteza zostaje wysublimowana w jedność; w tej perspektywie rzeczy, które nigdy wcześniej nie stykały się ze sobą, zostają nagle zestawione, użyte do oświecenia i pojęte… Opera, na przykład, i rewolucja.- Dwie decydujące Innowacje książki to po pierwsze zrozumienie zjawiska Dionizyjskiego wśród Greków: po raz pierwszy proponowana jest psychologiczna analiza tego zjawiska i uważana jest za jeden z korzeni całej sztuki greckiej. Drugim jest rozumienie Sokratyzmu: Sokrates uznawany jest po raz pierwszy za instrument rozpadu greckiego, jako typowy dekadent. „Racjonalność” przeciwko instynktowi. „Racjonalność” za wszelką cenę jako niebezpieczna siła, która podważa życie!- Głębokie, wrogie milczenie o chrześcijaństwie w całej książce. Nie jest to ani Apollinianin, ani Dionizyjczyk; neguje wszystkie wartości estetyczne – jedyne wartości, które uznaje „Narodziny tragedii”: jest nihilistyczny w najgłębszym znaczeniu, podczas gdy w symbolu Dionizyjskim osiąga się ostateczną granicę afirmacji. Istnieje jedna aluzja do księży chrześcijańskich jako „złośliwego rodzaju krasnoludów”, którzy są „podziemni”…”

w tytule powieści Czarodziejska góra Tomasz Mann nawiązuje do fragmentu z narodzin tragedii, a wpływ twórczości Nietzschego widać w postaci powieści Mynheer Peepercorn, uosabiającej”zasadę Dionizyjską”.

w kontekście krytycznego studium „ateistycznego humanizmu” Nietzschego, wpływowy teolog katolicki Henri de Lubac uznał go za „dzieło geniuszu” i poświęcił kilka stron swojej pracy, aby wyjaśnić związek między wczesną myślą Nietzschego a chrześcijaństwem.