Adso z Melk opowiada, jak w 1327 roku, jako młody nowicjusz Franciszkański (benedyktyn w powieści), on i jego mentor, franciszkanin William z Baskerville, udali się do Opactwa Benedyktynów w północnych Włoszech, gdzie Franciszkanie mieli debatować z papieskimi wysłannikami na temat ubóstwa Chrystusa. Opactwo szczyci się słynnym skryptorium, w którym skrybowie kopiują, tłumaczą lub oświetlają książki. Mnich Adelmo z Otranto— młody, ale sławny iluminator manuskryptów-został podejrzanie znaleziony martwy na zboczu wzgórza pod Wieżą z jedynie oknem, którego nie można otworzyć. Opat szuka pomocy u Williama, który jest znany ze swoich dedukcyjnych mocy. William jest niechętnie wciągnięty przez intelektualne wyzwanie i chęć obalenia strachu przed demonicznym winowajcą. William obawia się również, że opat wezwie urzędników Inkwizycji, jeśli tajemnica pozostanie nierozwiązana.

William szybko wywnioskował, że Adelmo popełnił samobójstwo, skoczył z pobliskiej wieży z oknem, a zbocze wzgórza spowodowało, że ciało przewróciło się pod drugą wieżą. Rozwiązanie Williama na krótko łagodzi obawy mnichów, dopóki inny mnich nie zostanie znaleziony martwy, złowieszczo unoszący się w kadzi ze świńską krwią. Ofiarą jest Wenancjusz, Tłumacz greki i ostatni człowiek, który rozmawiał z Adelmo. Zwłoki noszą czarne plamy na palcu i języku. Śmierć tłumacza rozbudza obawy mnichów przed nadprzyrodzonym winowajcą, obawy wzmocnione, gdy Święty franciszkanin ubertino z Casale ostrzega, że śmierć przypomina znaki wymienione w Księdze Objawienia. W scriptorium William sprawdza biurko Adelmo, ale zostaje zablokowany przez brata Berengara, asystenta bibliotekarza. Brat Malachia, główny bibliotekarz, odmawia Williamowi dostępu do reszty budynku.

William spotyka Salvatore, obłąkanego Garbusa, i jego Protektora, Remigio da varagine, piwowara. William wywnioskował, że obaj byli Dulcynitami, członkami heretyckiej, bojowej sekty, która wierzy, że duchowieństwo powinno być zubożałe. William nie podejrzewa ich jednak o morderstwo, ponieważ Dulcynici celują w bogatych biskupów, a nie w biednych mnichów. Niemniej jednak przeszłość Remigio daje Williamowi przewagę w poznawaniu tajemnic opactwa. Salvatore mówi Williamowi, że Adelmo spotkał Wenancjusza w noc śmierci Adelmo. W międzyczasie ADSO spotyka piękną, na wpół zdziczałą, wieśniaczkę, która zakradła się do opactwa, aby wymienić przysługi seksualne na jedzenie i zostaje przez nią uwiedziona.

Wracając tej nocy do biurka Wenancjusza, William znajduje książkę w języku greckim i pergamin z greckim pismem, smugi koloru zmieszanego przez Adelmo do oświetlania książek i tajemnicze symbole napisane przez leworęcznego mężczyznę przy użyciu niewidzialnego atramentu. Berengar zakrada się do mrocznego skryptorium, odwraca uwagę Williama i kradnie książkę.

Berengar został później znaleziony utopiony w wannie i noszący plamy podobne do tych na Wenancjuszu. William opowiada o swoich wnioskach, że śmierć Adelmo była rzeczywiście samobójstwem, z powodu poddania się prośbom Berengara o homoseksualne przysługi. Wenancjusz otrzymał pergamin od Adelmo przed śmiercią Adelmo, a Berengar jest jedynym leworęcznym człowiekiem w opactwie. William teoretyzuje, że Tłumacz przepisał Greckie notatki na pergaminie z książki i że książka jest w jakiś sposób odpowiedzialna za śmierć. Opat jest nieprzekonany i paląc pergamin, informuje Wilhelma, że Inkwizycja — w osobie Bernardo Gui, starego przeciwnika Wilhelma z czasów, gdy był inkwizytorem — została już wezwana.

zdeterminowani, aby rozwiązać zagadkę przed przybyciem Gui, William i Adso odkrywają ogromną, ukrytą bibliotekę nad skryptorium. William podejrzewa, że Opactwo ukryło książki, ponieważ większość ich treści pochodzi od pogańskich filozofów. Gui odnajduje Salvatore i wieśniaczkę walczącą o czarnego koguta w obecności czarnego kota. Dla Gui jest to niepodważalny dowód na czary i torturuje Salvatore ’ a do fałszywego przyznania się. Gdy przybywają Bracia Franciszkanie Wilhelma i delegaci papiescy, rozpoczyna się debata. Zielarz opactwa, po tym, jak powiedział Williamowi, że znalazł w swojej przychodni księgę napisaną po grecku, zostaje zamordowany przez to, co okazuje się być Malachią. Ten ostatni nakłania Remigio do próby ucieczki, przez co zostaje aresztowany przez strażników Gui i oskarżony o morderstwa.

Remigio, Salvatore i dziewczyna zostają postawieni przed Trybunałem. Pamiętając o Williamie, Gui wybiera go na opata jako sędziego Trybunału. Podczas procesu Remigio z dumą przyznaje się do swojej Dulcynitycznej przeszłości, a pod groźbą tortur również fałszywie przyznaje się do morderstw. William zwraca uwagę, że morderstwa są związane z grecką księgą, której Remigio nie mógł przeczytać, i ostrzega, że egzekucja Remigio nie zakończy morderstw. Gui organizuje spalenie więźniów na stosie, podczas gdy William zostanie zabrany do Awinionu. Delegaci papiescy potępili Franciszkanów za upór Wilhelma i zakończyli debatę.

gdy mnisi przygotowują się do spalenia więźniów Gui, Malachia zostaje znaleziony umierający, z czarnymi plamami na języku i palcu. Chociaż śmierć Malachii potwierdza Ostrzeżenie Williama, Gui przyjmuje to jako dowód, że William jest mordercą i nakazuje jego aresztowanie. Uciekając przed strażnikami Gui, William i Adso ponownie wchodzą do tajnej biblioteki i stają twarzą w twarz z niewidomym czcigodnym Jorge, najstarszym mieszkańcem opactwa. Po odszyfrowaniu wierszy na pergaminie tłumacza, William domaga się, aby Jorge przekazał książkę, którą czytali umarli: drugą Księgę poetyki o komedii Arystotelesa. Jorge nienawidzi śmiechu, myśląc, że podważa wiarę w Boga, a książka o śmiechu napisana przez Arisotle przyniesie śmiech tylko mędrcom i podważy wiarę wśród tych, którzy się uczą. Aby temu zapobiec, Jorge zabił tych, którzy przeczytali książkę, zatruwając jej strony. Jorge daje książkę Williamowi, myśląc, że on też ucierpi na truciźnie. Kiedy William ujawnia, że ma na sobie rękawiczki, Jorge chwyta książkę, a następnie rozpala ogień, który szybko ogarnia bibliotekę. William zostaje w tyle, próbując uratować część książek i zachęcając Adso do odejścia. Jorge zabija się przez spożywanie stron pokrytych trucizną.

widząc pożar, mnisi opuszczają więźniów, pozwalając miejscowym chłopom uratować dziewczynę, choć Salvatore i Remigio umierają. Adso goni Gui ’ ego, któremu udaje się uciec, ale chłopi zepchają jego wóz z klifu, wbijając go. Gdy William i Adso odchodzą, ADSO spotyka dziewczynę, zatrzymuje się na kilka sekund, ale ostatecznie postanawia iść z Williamem. Znacznie starszy Adso stwierdza, że nigdy nie żałował swojej decyzji, ponieważ nauczył się o wiele więcej rzeczy od Williama, zanim ich drogi się rozstały. Mówi również, że dziewczyna była jedyną ziemską miłością jego życia, ale nigdy nie nauczył się jej imienia.