Crocodylus intermedius-gatunek krokodyla zagrożony. Najważniejszą znaną populacją tego gatunku jest system rıo Cojedes (SRC), Wenezuela, obszar pod silną presją człowieka. Na podstawie nocnych obliczeń populację krokodyla Orinoko w SRC oszacowano w mynimo na 547 osobników (z wyjątkiem potomstwa). Skrawki w środkowa część SRC, szczególnie pod koniec rynny, wykazały główne wskaźniki populacji (7, 3 cala/km). Pośrednie wskaźniki populacji zaobserwowano w północnych i północnych kanionach rynnowych (odpowiednio 2, 2 i 4, 4 cala/km), miejscach SRC stosunkowo blisko ważnych ośrodków miejskich oraz stosunkowo wysokich poziomach zmienności zamieszkiwania i zanieczyszczenia. Niższe wskaźniki populacji (<1, 0 cala/km) zaobserwowano w obszarach żeglownych src oddalonych od dużych ośrodków miejskich. Populacje krokodyli w północnych miejscach src były zdominowane przez nieletnich, a dorośli i dorośli stanowili znaczną część populacji w miejscach o stosunkowo dużej gęstości krokodyli.