fosfolipase A2

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fosfolipase A2 é uma das proteínas de membrana mais intensivamente estudadas que hidrolisa fosfolípidos na posição sn-2 para formar ácidos gordos e produtos lisofosfolípidos. Estas são pequenas proteínas e as estruturas 3-D são conhecidas por alta resolução para várias espécies. As proteínas da fosfolipase A2 são de elevada preocupação farmacêutica, uma vez que são responsáveis pela libertação de ácido araquidónico a partir das membranas, e uma vez que a subsequente conversão deste ácido gordo em leucotrienos e prostaglandinas faz parte da resposta inflamatória. a enzima também mostra interacções muito interessantes com a membrana na qual se liga. Ele é ativado de alguma forma quando interage com formas agregadas do substrato, como em micelas ou em bilayers. Suspeita-se que interacções electrostáticas e hidrofóbicas estejam envolvidas na ligação da enzima à membrana. Muito pouco se sabe sobre a estrutura complexa enzima-membrana e por que a enzima reage muito mais eficientemente uma vez que liga seus substratos em uma forma agregada. estamos particularmente interessados em estudar a interação da fosfolipase A2 com a membrana celular através da modelagem molecular e dinâmica molecular. As questões de interesse são: o mecanismo da ativação da superfície; a interação de PLA2 com lípidos carregados negativamente; e as propriedades conformacionais e energéticas dos lípidos na interface proteína-membrana. Nossas simulações sugeriram que uma dessolivação de 2-3 moléculas lipídicas ocorre quando o PLA está estreitamente associado com a membrana, e pode facilitar a ligação do substrato, aumentando a taxa de reação. Também calculamos a superfície potencial da proteína na superfície da membrana. estamos a aplicar o método da dinâmica molecular dirigida para investigar a acção da proteína sinovial humana fosfolipase A2 (PLA2) na interface água lipídica. PLA2 liga-se a uma superfície de membrana em Modo de escavação e catalisa a reacção de hidrólise da ligação éster sn-2 dos fosfolípidos, resultando subsequentemente na destruição da superfície da membrana. Acredita-se que a catálise atual seja initiatada através da sucção de um fosfolípido da superfície da membrana para o canal h ydrofóbico de PLA2, onde a reação ocorre. O mecanismo desta sucção é pouco compreendido e é hipotetizado a ser causado por desestabilizatio n do headgroup de fosfolípidos polares pelo ambiente hidrofóbico do canal de ligação de PLA2. Investigamos o processo de extrusão do fosfolípido para dois modos de acoplamento do PLA2 à superfície da membrana, ou seja, modos de acoplamento estreito e oosely. A nossa hipótese é que antes de extrusar o fosfolípido, o PLA2 deve formar o complexo estreitamente ligado, enquanto que o complexo solto não deve levar à catálise.investigadores, investigadores, Serguei Izrailev, Feng Zhou, Klaus Schulten, publicações, H2, W3C, DTD XHTML 1.0 estudo de transição//EN” “http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd”>Publications Database Molecular dynamics study of the activation of fosfolipase A2 on a membrane surface.Feng Zhou e Klaus Schulten. PROTEINS:Structure, Function, and Genetics, 25: 12-27, 1996.