Aspergillus e Candida spp são os fungos mais frequentemente isolados em doentes com otomicose. O diagnóstico de otite externa baseia-se na história do paciente, exame otoscópico sob controle microscópico e estudos de imagem. A preparação direta dos espécimes, particularmente com branqueadores ópticos, cultura micológica e exame histológico, é muito importante e fortemente recomendada para o diagnóstico correto. Os doentes com otite externa fúngica não invasiva devem ser tratados com depredamento e limpeza intensos e antifúngicos tópicos. Antifúngicos tópicos, tais como clotrimazol, miconazol, bifonazol, ciclopiroxolamina e tolnaftato, são opções potencialmente seguras para o tratamento da otomicose, especialmente em doentes com um tímpano perfurado. Os medicamentos orais triazole, itraconazol, voriconazol e posaconazol são eficazes contra Candida e Aspergillus, com uma boa penetração óssea e do sistema nervoso central. Estes medicamentos são essenciais no tratamento de doentes com otite externa fúngica maligna complicada por mastoidite e meningite.