Crocodylus intermedius é uma das espécies de crocodilo mais ameaçadas. A população conhecida mais importante desta espécie encontra-se no sistema do rio Cojedes (SRC), Venezuela, uma área sob forte pressão humana. Com base nas contagens noturnas, a população do crocodilo Orinoco no SRC foi estimada em um mınimo de 547 indivíduos (excluindo crias). Seções no a parte média do SRC, particularmente no final do bico de água, mostraram os maiores índices populacionais (7,3 ind/km). Índices populacionais intermediários foram observados em Cojedes Norte e bico de água Norte (2, 2 e 4, 4 ind/km, respectivamente), seções do SRC relativamente próximas a importantes centros urbanos e, comparativamente, altos níveis de alteração de habitats e poluição. Os menores índices populacionais (<1.0 ind/km) foram observados em seções navegáveis do SRC Distantes dos grandes centros urbanos. A população de crocodilos nas seções do Norte do SRC foram dominadas por juvenis, enquanto sub-adultos e adultos representaram uma fração significativa da população em locais com relativamente altas densidades de crocodilos.