Trichoderma harzianum
a maioria das estirpes estão altamente adaptadas a um ciclo de vida assexuado. Na ausência de meiose, a plasticidade cromossômica é a norma, e diferentes estirpes têm diferentes números e tamanhos de cromossomos. A maioria das células tem inúmeros núcleos, com algumas células vegetativas possuindo mais de 100. Vários fatores genéticos assexuados, tais como recombinação parasexual, mutação e outros processos contribuem para a variação entre núcleos em um único organismo (thallus). Assim, os fungos são altamente adaptáveis e evoluem rapidamente. Há uma grande diversidade no genótipo e fenótipo das estirpes selvagens.
Enquanto cepas selvagens são altamente adaptáveis e podem ser heterokaryotic (contêm núcleos de diferentes genótipos dentro de um único organismo, e, portanto, altamente variável), as estirpes utilizadas para biocontrole na agricultura comercial são, ou deveriam ser, homokaryotic (núcleos são todos geneticamente idênticas ou similares). Isto, juntamente com o controle apertado da variação através da deriva genética, permite que essas estirpes comerciais sejam geneticamente distintas e não variáveis. Este é um item de controle de qualidade extremamente importante para qualquer empresa que deseje comercializar esses organismos.