He founded in 1984 The Bay Area Laboratory Co-operative (BALCO), a sports nutrition center first located in Millbrae, California and later relocated to Burlingame, California. A Agência Antidopagem dos Estados Unidos (USADA) diz que ele desenvolveu o esteróide banido tetrahidrogestrinona (THG) com a ajuda do químico de fisiculturismo Patrick Arnold. De acordo com um acordo feito com o Ministério Público, ele entrou em acusações de culpa em julho de 2005 para uma acusação de conspiração para distribuir esteróides e uma segunda acusação de lavagem de uma parte de um cheque. Ele foi condenado em outubro a passar quatro meses na instituição correcional federal Taft em Taft, Califórnia, e outros quatro em prisão domiciliar.em dezembro de 2004, ele participou de uma entrevista com Martin Bashir no programa 20/20 da ABC, onde ele admitiu a execução de programas de doping, que quebraram os recordes olímpicos, bem como revelou que: “Toda a história dos jogos está cheia de corrupção, encobrimento, consumo de drogas para melhorar o desempenho.”

na entrevista, ele implicou, entre outros, a medalhista de ouro olímpica Marion Jones e seu parceiro Tim Montgomery, Kelli White (que mais tarde admitiu usar drogas para melhorar o desempenho), o atleta Britânico Dwain Chambers, e o jogador da NFL Bill Romanowski.em 21 de dezembro de 2006, a Yahoo Sports informou que um dos advogados de defesa iniciais de Conte, Troy Ellerman, tinha sido alvo pelo FBI como uma possível fonte de vazamentos para a mídia durante a sonda Barry Bonds. Em 14 de fevereiro de 2007, Ellerman declarou-se culpado de vazar o testemunho do Grande Júri. Também foi relatado que os agentes do FBI eram uma fonte adicional de fugas.

Em maio de 2007, Conte alegou estar novamente fornecendo suplementos para Dwayne Chambers, que deixou o atletismo para jogar na NFL Europa league Para O Hamburg Sea Devils antes de retornar ao atletismo em 2008. De acordo com Conte, estes suplementos nutricionais, fornecidos através de sua empresa nutrição científica para condicionamento avançado, são perfeitamente legais.

em 13 de dezembro de 2007, Conte apareceu na CNN antes do relatório Mitchell ser lançado oficialmente.