Kessler jest głównym badaczem National Comorbidity Survey (NCS). NCS był pierwszym krajowym reprezentatywnym badaniem częstości występowania i korelatów zaburzeń psychicznych w Stanach Zjednoczonych. Badania przeprowadzono w 1991 i 1992 roku.

jest również głównym badaczem kilku rozszerzeń NCS, w tym 10-letniej obserwacji podstawowej próbki NCS i replikacji NCS w 2001 i 2002 w celu zbadania zmian w zdrowiu psychicznym i leczeniu zaburzeń psychicznych w USA w ciągu dekady lat 90.

koordynuje również badania Światowej Organizacji Zdrowia (WMH), serię krajowych reprezentatywnych badań epidemiologicznych przeprowadzonych w 28 krajach o łącznej wielkości próby ponad 200 000 respondentów. Badania przeprowadzone przez World Mental Health mają na celu dostarczenie informacji dla planistów rządowych, aby pomóc w kierowaniu inwestycjami w opiekę nad zdrowiem psychicznym.

jest zaangażowany w projektowanie i wdrażanie kilku eksperymentalnych interwencji w miejscu pracy w Stanach Zjednoczonych, Ameryce Łacińskiej i Azji, mających na celu określenie opłacalności różnych programów zarządzania chorobami w miejscu pracy z perspektywy pracodawcy. Zajmuje się również projektowaniem, wdrażaniem i oceną długofalowych efektów programów interwencyjnych dla młodzieży z problemami emocjonalnymi. Kieruje również grupą doradczą ds. huraganu Katrina, panelowym badaniem adaptacji psychologicznej wśród osób, które były mieszkańcami obszarów dotkniętych huraganem Katrina w czasie burzy.

jego obecne badania obejmują przeprowadzenie ankiety NCS adolescent (NCS-A), pierwszego ogólnokrajowego reprezentatywnego badania zdrowia psychicznego nastolatków w Stanach Zjednoczonych. Uczestnikami jest ponad 10 000 nastolatków oraz ich rodzice i nauczyciele.