Kessler é o principal investigador do National Comorbidity Survey (NCS). A NCS foi a primeira pesquisa nacional representativa da prevalência e correlatos de distúrbios psiquiátricos nos Estados Unidos. O inquérito foi realizado em 1991 e 1992.

He is also the principal investigator of several NCS extensions, including a 10-year follow-up of the baseline NCS sample and a replication of the NCS in 2001 and 2002 to study changes in mental health and treatment of mental disorders in the U. S. over the decade of the 1990s.ele também codifica as pesquisas da Organização Mundial de saúde sobre saúde Mental (WMH), uma série de pesquisas epidemiológicas representativas a nível nacional realizadas em 28 países com uma amostra combinada de mais de 200.000 entrevistados. As pesquisas realizadas pela World Mental Health são projetadas para fornecer informações para planejadores do governo para ajudar a orientar os investimentos em cuidados de saúde mental.ele está envolvido na concepção e implementação de várias intervenções experimentais no local de trabalho nos Estados Unidos, América Latina e Ásia, com o objetivo de determinar a relação custo-eficácia de diversos programas de gestão de doenças no local de trabalho do ponto de vista do empregador. Ele também está envolvido na concepção, implementação e avaliação dos efeitos a longo prazo de programas de intervenção para jovens com problemas emocionais. Ele também dirige o Hurricane Katrina Community Advisory Group, um painel de estudo do ajuste psicológico entre as pessoas que eram residentes das áreas afetadas pelo Furacão Katrina na época da tempestade.

sua pesquisa atual envolve a realização da pesquisa NCS adolescent (NCS-a), a primeira pesquisa representativa Nacional de saúde mental adolescente já feita nos Estados Unidos. Os participantes são mais de 10.000 adolescentes e seus pais e professores.