Der anfängliche Ausbruch der Krankheit fand im Regency Park-Komplex statt, der 69 Wohneinheiten hatte, die in drei Gruppen mit jeweils drei Stockwerken Höhe in Kew Gardens im New Yorker Stadtteil Queens organisiert waren. Ärzte, die Patienten ab Anfang 1946 gesehen hatten, hatten angenommen, dass sie es mit einer atypischen Form von Windpocken zu tun hatten, aber die Erkenntnis wurde gemacht, dass sie es mit einer lokalisierten Epidemie unbekannter Herkunft zu tun hatten, die im Sommer dieses Jahres begann. Die Ärzte befragten die Bewohner des Gebäudes und stellten fest, dass es von Januar bis Oktober 124 Fälle dieser Krankheit unter den 2.000 in dem Komplex lebenden Menschen gegeben hatte, was einen Höchststand von mehr als 20 Fällen erreichte, die im Juli gemeldet wurden. Die erkrankten Personen waren im Alter von 3 Monaten bis 71 Jahren alt, Männer und Frauen waren gleichermaßen betroffen und die Inzidenz bei Erwachsenen (6,5% der 1.400 über 15-Jährigen) überstieg die von Kindern unter 14 Jahren (5,3%).

Individuen hätten zuerst eine kleine Läsion an der Stelle des Insektenstichs, die schließlich eine kleine Narbe hinterlassen würde. Die Lymphknoten würden sich vergrößern und etwa eine Woche nach dem ersten Biss würden die Patienten Schüttelfrost, Fieber und Kopfschmerzen verspüren, begleitet von einem makulopapulären Hautausschlag. Der Ausschlag würde etwa eine Woche dauern, wobei der volle Fortschritt von der Läsion bis zur Genesung typischerweise drei Wochen beträgt. Mehrere Merkmale wurden aus epidemiologischer Sicht als korreliert mit der Erkrankung betrachtet. Männer und Frauen waren gleichermaßen betroffen und es gab keinen offensichtlichen Zusammenhang mit Beruf oder Schulbesuch. Die Personen erhielten ihre Mahlzeiten aus verschiedenen Quellen, und andere Personen, die anderswo lebten und ihre Lebensmittel an denselben Orten kauften, waren nicht betroffen. Die Wasserversorgung und die dort verbrauchte Milch wurden getestet, ohne ungewöhnliche Ergebnisse. Es gab Hundezwinger in der Gegend und einige Mieter hatten Hunde als Haustiere, aber eine Inspektion der Tiere fand keine Zecken oder Insekten.

Viele Bewohner hatten von Mäusen in und um die Wohnungen berichtet, insbesondere in den Kellern der Gebäude in der Nähe der Verbrennungsanlagen, in denen lebende und tote Mäuse gefunden wurden. Müll, der durch Verbrennungsrinnen entsorgt wurde, sollte täglich verbrannt werden, wobei die Asche vom New Yorker Department of Sanitation abtransportiert wurde. Aufgrund von Arbeitskräftemangel wurde das Material nicht regelmäßig verbrannt, so dass den Nagetieren ausreichend Nahrung zur Verfügung stand. Mäuse wurden in Wohnungen und in der Nähe der Verbrennungsanlagen gefangen und Antikörper gegen die Rickettsienpocken wurden in ihrem Blut gefunden. Huebner besuchte den Komplex mit dem Schädlingsbekämpfungsspezialisten und selbst ausgebildeten Entomologen Charles Pomerantz und schälte Tapeten zurück, um die mit Milben wimmelnden Wände zu finden, so dass die Mieter gesagt hatten, dass „die Wände Bewegung hatten“. Die Milben wurden gesammelt und aus einigen von ihnen wurden Rickettsienstämme isoliert, wobei dem Organismus der Name Rickettsia akari gegeben wurde.

Beamte des öffentlichen Gesundheitswesens unternahmen Schritte, um weitere Ausbrüche der Krankheit zu verhindern. Die Gebäudebetreiber wurden angewiesen, sicherzustellen, dass die Verbrennungsanlagen regelmäßig angezündet wurden, um sicherzustellen, dass die den Mäusen, die die Krankheit beherbergten, zur Verfügung stehenden Lebensmittel so schnell und gründlich wie möglich beseitigt wurden. Schädlingsbekämpfungsmaßnahmen wurden durch das New Yorker Gesundheitsministerium und seinen Kommissar Israel Weinstein ergriffen, um die Mäuse in und um die Gebäude in Zusammenarbeit mit den Eigentümern zu beseitigen.Weitere 20 Fälle von Rickettsienpocken wurden an anderer Stelle in New York City während der Untersuchung des Queens-Ausbruchs entdeckt, darunter 10 Fälle in einem Wohnhaus in der Bronx, die ursprünglich als atypische Windpocken diagnostiziert worden waren. Im Keller dieses Gebäudes wurden Mäuse sowie Milben derselben Klasse gefunden, die in Königinnen gefunden wurden. Zusätzlich zu den ersten Fällen des ersten Ausbruchs in Queens wurden von 1947 bis 1951 in New York City über 500 Fälle der Krankheit diagnostiziert.