Prosite
PROSITEは、適切な計算ツールを使用して、タンパク質に存在するドメイン(もしあれば)を迅速かつ確実に識別するために使用できるように、生物学的に重要なタンパク質ドメインとパターンのデータベースであるため、タンパク質機能が何であるかのヒントを与える。
アプリケーション
主に新しいタンパク質機能が何であるかを理解するのに役立ちます。 Psscanツールは、新しいシーケンスでPROSITEパターンの検索を実行するのに役立ちます。
主要な機能
- 署名は、署名によって検出されたタンパク質ドメインに関する情報を含む注釈文書にリンクされています(i.Eその名前の起源、分類学的発生、ドメインアーキテクチャ、機能、3D構造、配列の主な特性、ドメインサイズおよび文献参照)
- シグネチャは、UniProtKB/Swiss-Protデータベースで使
詳細情報
主な利点
ドメインとそれに対応するパターン、プロファイルまたは署名が手動でチェックされ、慎重にドメイン割り当ての精度
文学
Sigrist CJA,de Castro E,Cerutti L,Cuche BA,Hulo N,Bridge A,Bougueleret L,Xenarios I.PROSITEでの新規および継続的な開発。 Nucleic Acids Res.2012;doi:10.1093/nar/gks1067(PDF)
Sigrist CJA,Cerutti L,Hulo N,Gattiker A,Falquet L,Pagni M,Bairoch A,Bucher P.PROSITE: モチーフ記述子としてパターンとプロファイルを使用して文書化されたデータベース。 簡単なバイオインフォーム。 3:265-274(2002)(PDF)