Oppfinnelse Nyhet

denne oppfinnelsen består av programvare som letter modellering og interaktiv visualisering av molekylære strukturer og relaterte data.

Value Proposition

Modellering og visualisering av molekylære strukturer er avgjørende for å få innsikt i biologisk funksjon og molekylære interaksjoner, samt for narkotika design og utvikling. For å møte forskerbehov har den utvidbare programvareplattformen UCSF Chimera blitt utviklet av Ressursen For Biokomputing, Visualisering og Informatikk (RBVI). Denne programvaren gir mulighet for 3-D visualisering og strukturell analyse av molekylære enheter, og forbedrer forsker arbeidsflyt med nye utvidelsesfunksjoner.

denne programvaren tilbyr følgende fordeler:- Visualisering av molekylære data på alle skalaer, inkludert store molekylære forsamlinger

-Integrert sekvens og struktur visninger

-Produksjon av høykvalitets bilder og filmer for publisering og presentasjon

-Designet for å imøtekomme utenfor utvikling av programvareutvidelser

-Bred bruk for akademiske og industri forskere, lærere og studenter

Teknologibeskrivelse

UCSF chimera tilbyr 3d-visualisering av molekylære strukturer og relaterte data, inkludert tetthetskart, supramolekylære forsamlinger, molekylære dynamikkbaner og flere sekvensjusteringer. Brukeren kan også lage bilder og animasjoner for publisering og presentasjon. I tillegg til å støtte kjernevisualisering, er programvaren spesielt utviklet for utvidbarhet, slik at eksterne utviklere kan innlemme nye ønskelige funksjoner. Nåværende utvidelser inkluderer Multiscale-Modeller for å visualisere store molekylære forsamlinger som virale strøk, ViewDock til skjermdokkede ligandretninger, Volumviser for å visualisere tetthetskart og Multalign Viewer for å vise sekvensjusteringer, med crosstalk til eventuelle tilknyttede strukturer.

noen eksempler inkluderer:

1. Grafisk fremstilling av tumorprotein p53 binding TIL DNA, med lokaliseringer av kreftassosierte mutasjoner merket med rødt:

2. Grafisk fremstilling av et elektrontetthetskart over Semliki-skogviruset. Viruset kan forårsake dødelig encefalitt hos gnagere, men generelt bare milde symptomer hos mennesker:

3. Video Av Menneskelig Hjerne: Bilder Til Atomer. 31. januar 2014 (Direct Link – https://www.youtube.com/watch?v=RE2XMzInX_o) bildene virker forvrengt da denne videoen var ment å bli projisert på en kuppelformet projeksjonsskjerm.

Relaterte Materialer

• Første publikasjon: UCSF Chimera – et visualiseringssystem for utforskende forskning og analyse (J Comput Chem. 2004)
• denne oppfinnelsen har også en liste over mange tilknyttede publikasjoner.