PROSITE é um banco de dados de biologicamente significativas de proteína de domínios e padrões formulados de tal forma que com as devidas ferramentas computacionais que podem ser usados de forma rápida e confiável para identificar quais os domínios que estão presentes em uma proteína (se houver), portanto, dar uma dica de qual a função da proteína pode ser.

aplicações

principalmente úteis para entender o que uma nova função proteica pode ser. A ferramenta psscan irá ajudar a realizar a busca por padrões de PROSITE em uma nova sequência.

as principais características

• As assinaturas estão ligadas a um documento de anotação contendo a informação sobre o domínio proteico detectado pela assinatura(I.e a origem do seu nome, taxonômicos ocorrência, arquitetura de domínio, função, estrutura 3D, as principais características da sequência, tamanho domínio e referências bibliográficas)
• Assinaturas estão associadas com a correspondente ProRules , que contêm informações para o automatizado de anotação de domínios de uma nova proteína em um formato padronizado semelhante ao usado pela a uniprotkb/Swiss-Prot banco de dados
• a Informação armazenada na ProRule pode ser acedido através de ScanProsite, o que oferece recursos adicionais, tais como sítios ativos ou ligações dissulfeto associado a um domínio específico

Mais informações

principais vantagens

porque os domínios e seus padrões, perfis ou assinaturas correspondentes são verificados manualmente, e cuidadosamente revisado a precisão da atribuição de domínio é incomparável.

literatura

Sigrist CJA, de Castro e, Cerutti L, Cuche BA, Hulo N, Bridge a, Bougueleret L, Xenarios I. desenvolvimentos novos e contínuos na PROSITE. Nucleic Acids Res. 2012; doi: 10.1093/nar/gks1067 (PDF)
Sigrist CJA, Cerutti L, Hulo N, Gattiker a, Falquet L, Pagni M, Bairoch a, Bucher P. PROSITE: uma base de dados documentada que utiliza padrões e perfis como descritores de motivos. Breve Bioinformação. 3: 265-274 (2002) (PDF)

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