Vynález Novost

Tento vynález se skládá ze software, který umožňuje modelování a interaktivní vizualizace molekulárních struktur a související údaje.

Value Proposition

modelování a vizualizace molekulárních struktur jsou rozhodující pro získání vhledu do biologických funkcí a molekulárních interakcí, jakož i pro návrh a vývoj léčiv. Na adresu výzkumník potřebuje, rozšiřitelné softwarové platformy UCSF Chimera byl vyvinut Zdroj pro Biocomputing, Vizualizace a Informatika (RBVI). Tento software umožňuje 3D vizualizaci a strukturální analýzu molekulárních entit a zlepšuje pracovní postup výzkumníka s novými funkcemi rozšíření.

tento software nabízí následující výhody:

-Bohatou sadu funkcí jsou přístupné přes oba příkazy a grafické rozhraní

-Vizualizace molekulárních dat na všech úrovních, včetně velké molekulární sestavy

-Integrované sekvence a struktury názory

-Výroba vysoce kvalitních snímků a filmů pro zveřejnění a prezentaci

-Navržen tak, aby ubytovat mimo vývoj software rozšíření

-Široké použití pro akademických a výzkumných pracovníků průmyslu, pedagogové a studenti

Technologie Popis

UCSF Chimera nabízí 3-D vizualizaci molekulárních struktur a související údaje, včetně mapy hustoty, supramolekulární sestavy, trajektorie molekulární dynamiky a zarovnání více sekvencí. Uživatel může také vytvářet obrázky a animace pro publikaci a prezentaci. Kromě podpory jádra, vizualizace, software je speciálně navržen pro rozšiřitelnost, aby mimo vývojářům začlenit nové žádoucí funkce. Současné rozšíření zahrnuje Víceměřítkových Modelů k vizualizaci rozsáhlých molekulární sestavy, jako jsou virové kabáty, ViewDock k obrazovce zakotvila ligand směry, Volume Viewer vizualizovat hustotu mapy, a Multalign Viewer k zobrazení sekvence zarovnání, s přeslechy, aby jakékoliv související struktury.

některé příklady zahrnují:

1. Grafické znázornění tumor protein p53 vazba na DNA, s místy rakoviny-mutace související označeny červeně:

2. Grafické znázornění mapy elektronové hustoty lesního viru Semliki. Virus je schopen způsobit smrtelnou encefalitidu u hlodavců, ale obecně pouze mírné příznaky u lidí:

3. Video lidského mozku: obrazy na atomy. 31. ledna 2014 (Přímý Odkaz – https://www.youtube.com/watch?v=RE2XMzInX_o) obrázky Se objeví zkreslený, protože to video mělo být promítané na kopuli ve tvaru projekční plátno.

Související Materiál

• První publikace: UCSF Chimera – vizualizační systém pro předběžný výzkum a analýzy (J Poč Chem. 2004)
• tento vynález má také seznam mnoha souvisejících publikací.