発明の新規性

この発明は、分子構造および関連データのモデリングと対話型の可視化を容易にするソフトウェアで構成されています。

価値提案

分子構造のモデリングと可視化は、生物学的機能と分子相互作用への洞察を得るためだけでなく、薬物設計と開発のために重要です。 研究者のニーズに対応するために、拡張可能なソフトウェアプラットフォームUCSF Chimeraは、Resource for Biocomputing,Visualization,and Informatics(RBVI)によって開発されました。 このソフトウェアは分子実体の3-D視覚化そして構造解析を可能にし、新しい延長特徴との研究者のワークフローを高める。

このソフトウェアには次の利点があります:

-コマンドとグラフィカルインターフェイスの両方を介してアクセス可能な機能の豊富なセット

-大規模な分子集合体を含むすべてのスケールでの分子データの可視化

-統合されたシーケンスと構造ビュー

-出版とプレゼンテーションのための高品質の画像やムービーの生産

-ソフトウェア拡張機能の外部開発に対応するように設計

-学術および業界の研究者、教育者、および学生のための広範な使用

技術説明

UCSFキメラは、以下を含む分子構造および関連データの3-d可視化を提供しています 密度マップ、超分子集合体、分子動力学の軌道、および複数の配列整列。 また、ユーザーは、出版物やプレゼンテーションのための画像やアニメーションを作成することができます。 コアの可視化をサポートするだけでなく、外部の開発者が新しい望ましい機能を組み込むことを可能にするために、ソフトウェアは、特に拡張性のた 現在の拡張機能には、ウイルスコートのような大規模な分子集合体を視覚化するマルチスケールモデル、ドッキングされたリガンドの向きをスクリーニングするViewDock、密度マップを視覚化するボリュームビューア、および関連する構造へのクロストークを伴うシーケンス整列を表示するMultalignビューアが含まれています。いくつかの例が含まれます：

いくつかの例が含まれます：

1。 DNAに結合する腫瘍タンパク質p53のグラフィカルな表現、癌関連変異の位置が赤色でマークされています：

2。 Semliki Forestウイルスの電子密度マップのグラフィカルな表現。 このウイルスはげっ歯類で致命的な脳炎を引き起こすことができますが、一般的にはヒトでは軽度の症状のみです：

3。 人間の脳のビデオ：原子への画像。 January31,2014(Direct Link-https://www.youtube.com/watch?v=RE2XMzInX_o)このビデオはドーム型の投影スクリーンに投影されることを意図していたため、画像は歪んで見えます。

関連資料

• 最初の出版物：UCSFキメラ–探索的研究と分析のための可視化システム（J Comput Chem. 2004)
• 本発明はまた、多くの関連する出版物のリストを有する。