Taxonomie ist die Wissenschaft, die alle Organismen erforscht, beschreibt, benennt und klassifiziert. In diesem einleitenden Kapitel beleuchten wir die wichtigsten historischen Schritte bei der Ausarbeitung dieser Wissenschaft, die Basisdaten für alle Bereiche der Biologie liefert und eine wichtige Rolle für die Gesellschaft spielt, aber auch eine unabhängige, komplexe und solide hypothesengetriebene wissenschaftliche Disziplin ist.In einem ersten Teil unterstreichen wir, dass die Pflanzentaxonomie eine der frühesten wissenschaftlichen Disziplinen ist, die vor Tausenden von Jahren entstanden ist, noch vor den wichtigen Beiträgen der Griechen und Römer (z. B. Theophrastus, Plinius der Ältere und Dioskorides). Im fünfzehnten bis sechzehnten Jahrhundert profitierte die Pflanzentaxonomie von den Großen Navigationen, der Erfindung der Druckmaschine, der Schaffung botanischer Gärten und der Verwendung der Trocknungstechnik zur Konservierung von Pflanzenproben. Parallel zur wachsenden Anzahl morpho-anatomischer Daten umfassen die folgenden wichtigen Schritte in der Geschichte der Pflanzentaxonomie die Entstehung des Konzepts der natürlichen Klassifikation, die Einführung des binomischen Benennungssystems (mit der Hauptrolle von Linnaeus) und anderer universeller Regeln für die Benennung von Pflanzen, die Formulierung des Prinzips der Unterordnung von Zeichen und das Aufkommen des evolutionären Denkens. In jüngerer Zeit erlaubten die kladistische Theorie (initiiert von Hennig) und die raschen Fortschritte in der DNA-Technologie, Phylogenien abzuleiten und echte natürliche, genealogische classifications.In in einem zweiten Teil legen wir den Schwerpunkt auf die Herausforderungen, mit denen die Pflanzentaxonomie heutzutage konfrontiert ist. Das immer noch sehr unvollständige taxonomische Wissen über die weltweite Flora (das sogenannte taxonomische Hindernis) behindert die Erhaltungsbemühungen, die besonders wichtig sind, da die biologische Vielfalt in ihre sechste Aussterbungskrise eintritt. Es scheint hauptsächlich auf unzureichende Finanzierung, mangelndes taxonomisches Fachwissen und mangelnde Kommunikation und Koordination zurückzuführen zu sein. Wir überprüfen dann die jüngsten Initiativen, um diese Einschränkungen zu überwinden und zu antizipieren, wie sich die Taxonomie entwickeln sollte und könnte. Insbesondere die Verwendung molekularer Daten war für die Taxonomie von entscheidender Bedeutung und kann ein beschleunigtes Tempo bei der Entdeckung von Arten ermöglichen. Wir untersuchen sowohl Stärken als auch Grenzen solcher Techniken im Vergleich zu morphologiebasierten Untersuchungen, Wir geben breite Empfehlungen zur Verwendung molekularer Werkzeuge für die Pflanzentaxonomie, und wir heben die Notwendigkeit einer integrativen Taxonomie hervor, die auf Beweisen aus mehreren Quellen basiert.