Taxonomy is the science that explores, describes, names, and classifies all organisms. Neste capítulo introdutório, destacamos os principais passos históricos na elaboração desta ciência que fornece dados de base para todos os campos da biologia e desempenha um papel vital para a sociedade, mas também é uma disciplina científica independente, complexa e sólida baseada em hipóteses.Em uma primeira parte, sublinhamos que a taxonomia vegetal é uma das primeiras disciplinas científicas que surgiram há milhares de anos, mesmo antes das contribuições importantes dos gregos e romanos (por exemplo, Teofrasto, Plínio, o Velho, e Dioscórides). Nos séculos XV a XVI, a taxonomia vegetal beneficiou das Grandes Navegações, da invenção da imprensa, da criação de jardins botânicos e do uso da técnica de secagem para preservar espécimes de plantas. Em paralelo com o crescente número de morfo-anatômica de dados, subsequente grandes etapas na história da planta taxonomia incluem o surgimento do conceito de classificação natural, a adoção do sistema de nomenclatura binomial (com o papel principal de Lineu) e outras regras universais para a atribuição de nomes de plantas, a formulação do princípio da subordinação dos caracteres, e o advento do pensamento evolutivo. Mais recentemente, a teoria cladística (iniciada por Hennig) e os rápidos avanços nas tecnologias de DNA permitiram inferir filogenias e propor verdadeiras naturais, baseadas na genealogia classifications.In uma segunda parte, colocamos a ênfase nos desafios que a taxonomia vegetal enfrenta hoje em dia. O conhecimento taxonômico ainda muito incompleto da flora mundial (o chamado impedimento taxonômico) está seriamente prejudicando os esforços de conservação que são especialmente cruciais à medida que a biodiversidade entra em sua sexta crise de extinção. Parece dever-se principalmente a um financiamento insuficiente, à falta de conhecimentos taxonómicos e à falta de comunicação e coordenação. Em seguida, analisamos as iniciativas recentes para superar essas limitações e antecipar como a taxonomia deve e pode evoluir. Em particular, o uso de dados moleculares tem sido a divisão era para taxonomia e pode permitir um ritmo acelerado de descoberta de espécies. Examinamos os pontos fortes e as limitações de tais técnicas em comparação com as investigações baseadas na morfologia, damos amplas recomendações sobre o uso de ferramentas moleculares para a taxonomia vegetal, e destacamos a necessidade de uma taxonomia Integrativa baseada em evidências de múltiplas fontes.