BLAST sequence similarity searching
suoritetaan Blast search…
- valitse sivun yläreunassa olevan työkalupalkin ”Blast” – välilehti suorittaaksesi sekvenssin samankaltaisuuden haun Blast-ohjelman kanssa.
- Kirjoita joko proteiini-tai nukleotidisekvenssi tai UniProt-tunniste lomakenttään (Kuva 37).
- napsauta ”Run Blast” – painiketta.
Blast-hakuja voi ajaa suoraan Uniprotin hakusivujen ”Blast” – painikkeesta. Kaikilla oleellisilla tulossivuilla (kuten UniProtKB, UniRef, UniParc ja työkalutulokset) voit suorittaa Blast-haun suoraan valitsemalla valintaruudun. Voit myös suorittaa Blast-hakuja ’Korin’ sisältä.
seuraavanlaisia UniProt-tunnisteita tuetaan:
| P00750 | UniProtKB entry |
| P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
| P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
| A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
| UPI0000000001 | UniParc entry |
| UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you valitse työkalurivin’ Blast ’ – välilehti uniprotkb -, UniRef-tai UniParc-aloitussivulta, nykyinen järjestys on esitäytetty lomakkeessa.
työtehtävillä on yksilölliset tunnisteet, joita (työtyypistä riippuen) voidaan käyttää kyselyissä (esim.kahden peräkkäisen samankaltaisuushaun leikkauspisteen saamiseksi). Työtunnukset ja niihin liittyvät tiedot säilytetään seitsemän päivää, minkä jälkeen ne poistetaan.
valinnaiset asetukset
luettelo Blast-haun valinnaisista asetuksista löytyy Ohje-osiosta.