Articles

wyszukiwanie podobieństwa sekwencji wybuchu

wykonywanie wyszukiwania wybuchu…

  1. wybierz zakładkę 'Blast’ na pasku narzędzi u góry strony, aby uruchomić wyszukiwanie podobieństwa sekwencji za pomocą programu Blast.
  2. wprowadź sekwencję białka lub nukleotydu lub identyfikator UniProt do pola formularza (Fig.37).
  3. kliknij przycisk’ Uruchom Blast’.
rysunek 37 the blast input page.

Wyszukiwanie blastów można uruchomić bezpośrednio z przycisku 'Blast’ na stronach wpisów UniProt. Wszystkie odpowiednie strony wyników (takie jak UniProtKB, UniRef, UniParc i tool results) umożliwiają bezpośrednie uruchomienie wyszukiwania Blast poprzez zaznaczenie wpisu za pomocą pola wyboru. Możesz również uruchomić wyszukiwanie wybuchowe z poziomu „koszyka”.

obsługiwane są następujące rodzaje identyfikatorów UniProt:

P00750 UniProtKB entry
P00750-2 UniProtKB entry isoform sequence
P00750 Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive)
A4_HUMAN UniProtKB entry name
UPI0000000001 UniParc entry
UniRef100_P00750 UniRef entry

If you wybierz zakładkę 'Blast’ na pasku narzędzi ze strony wejścia UniProtKB, UniRef lub UniParc, bieżąca sekwencja jest wstępnie wypełniana w formularzu.

zadania mają unikalne identyfikatory, które (w zależności od rodzaju zadania) mogą być używane w zapytaniach (np. aby uzyskać przecięcie dwóch wyszukiwań podobieństwa sekwencji). Identyfikatory zadań i Powiązane Dane są przechowywane przez siedem dni, a następnie usuwane.

opcjonalne ustawienia

lista opcjonalnych ustawień wyszukiwania Blast znajduje się w sekcji pomocy.