BLAST sequence similarity searching
Esecuzione di una ricerca Blast search
- Selezionare la scheda ‘Blast’ della barra degli strumenti nella parte superiore della pagina per eseguire una ricerca di similarità sequenza con il programma Blast.
- Immettere una sequenza di proteine o nucleotidi o un identificatore UniProt nel campo modulo (Figura 37).
- Fare clic sul pulsante ‘Esegui esplosione’.
Le ricerche Blast possono essere eseguite direttamente dal pulsante ‘Blast’ nelle pagine di ingresso UniProt. Tutte le pagine dei risultati rilevanti (come UniProtKB, UniRef, UniParc e risultati degli strumenti) consentono di eseguire una ricerca Blast direttamente selezionando una voce utilizzando una casella di controllo. È inoltre possibile eseguire ricerche Blast all’interno del ‘Cestino’.
Sono supportati i seguenti tipi di identificatori UniProt:
| P00750 | UniProtKB entry |
| P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
| P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
| A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
| UPI0000000001 | UniParc entry |
| UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you selezionare la scheda’ Blast ‘ della barra degli strumenti da una pagina di ingresso UniProtKB, UniRef o UniParc, la sequenza corrente viene precompilata nel modulo.
I lavori hanno identificatori univoci, che (a seconda del tipo di lavoro) possono essere utilizzati nelle query (ad esempio per ottenere l’intersezione di due ricerche di somiglianza di sequenza). Gli identificatori del lavoro e i relativi dati vengono conservati per sette giorni e vengono quindi cancellati.
Impostazioni opzionali
Un elenco di impostazioni opzionali per la ricerca Blast può essere trovato nella sezione aiuto.