Articles

BLAST sekvenční podobnost hledání

Provedení Výbuch hledat…

  1. Vyberte „Výbuch“ kartu na panelu nástrojů v horní části stránky spustit sekvenční podobnost vyhledávání pomocí Blast programu.
  2. zadejte do pole formuláře buď proteinovou nebo nukleotidovou sekvenci nebo identifikátor Uniprotu (obrázek 37).
  3. klikněte na tlačítko „Spustit výbuch“.
Obrázek 37 Výbuchu vstupní stránku.

vyhledávání výbuchů lze spustit přímo z tlačítka „Blast“ na vstupních stránkách UniProt. Všechny relevantní stránky s výsledky (například UniProtKB, UniRef, UniParc a výsledky nástrojů) umožňují spustit vyhledávání výbuch přímo výběrem položky pomocí zaškrtávacího políčka. Můžete také spustit výbuch vyhledávání v rámci „koše“.

jsou podporovány následující typy identifikátorů UniProt:

P00750 UniProtKB entry
P00750-2 UniProtKB entry isoform sequence
P00750 Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive)
A4_HUMAN UniProtKB entry name
UPI0000000001 UniParc entry
UniRef100_P00750 UniRef entry

If you vyberte kartu ‚Blast‘ na panelu nástrojů ze vstupní stránky UniProtKB, UniRef nebo UniParc, aktuální sekvence je předvyplněna ve formuláři.

Práce mají jedinečné identifikátory, které (v závislosti na typ úlohy) lze použít v dotazech (např. získat průsečík dvou sekvenční podobnost vyhledávání). Identifikátory úlohy a související údaje jsou uchovávány po dobu sedmi dnů a poté jsou vymazány.

volitelná nastavení

seznam volitelných nastavení pro vyhledávání výbuchů naleznete v části Nápověda.