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Búsqueda de similitud de secuencia de explosión

Realizar una búsqueda de explosión Select

  1. Seleccione la pestaña «Explosión» de la barra de herramientas en la parte superior de la página para ejecutar una búsqueda de similitud de secuencia con el programa de explosión.
  2. Introduzca una secuencia de proteínas o nucleótidos o un identificador UniProt en el campo de formulario (Figura 37).
  3. Haga clic en el botón «Ejecutar explosión».
Figura 37 la Explosión de La página de entrada.

Las búsquedas de Blast se pueden ejecutar directamente desde el botón «Blast» en las páginas de entrada de UniProt. Todas las páginas de resultados relevantes (como UniProtKB, UniRef, UniParc y resultados de herramientas) le permiten ejecutar una búsqueda directa seleccionando una entrada utilizando una casilla de verificación. También puedes realizar búsquedas explosivas desde la ‘Cesta’.

Se admiten los siguientes tipos de identificadores UniProt:

P00750 UniProtKB entry
P00750-2 UniProtKB entry isoform sequence
P00750 Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive)
A4_HUMAN UniProtKB entry name
UPI0000000001 UniParc entry
UniRef100_P00750 UniRef entry

If you seleccione la pestaña ‘Blast’ de la barra de herramientas desde una página de entrada UniProtKB, UniRef o UniParc, la secuencia actual se rellena previamente en el formulario.

Los trabajos tienen identificadores únicos, que (dependiendo del tipo de trabajo) se pueden usar en consultas (por ejemplo, para obtener la intersección de dos búsquedas de similitud de secuencias). Los identificadores de trabajo y los datos relacionados se conservan durante siete días y luego se eliminan.

Ajustes opcionales

En la sección de ayuda se puede encontrar una lista de ajustes opcionales para la búsqueda de explosiones.