BLAST sequence similarity search
Blast searching végrehajtása…
- válassza ki az oldal tetején található eszköztár ‘Blast’ fülét a sorozat hasonlósági keresés futtatásához a Blast programmal.
- adjon meg egy fehérje-vagy nukleotidszekvenciát vagy egy UniProt azonosítót az űrlapmezőbe (37.ábra).
- kattintson a ‘Run Blast’ gombra.
A Blast keresések közvetlenül a “Blast” gombról futtathatók az UniProt belépési oldalakon. Az összes releváns találati oldal (mint például az UniProtKB, UniRef, UniParc és tool results) lehetővé teszi, hogy közvetlenül futtasson egy Robbanáskeresést egy bejegyzés kiválasztásával egy jelölőnégyzet segítségével. A Robbanáskereséseket a kosárból is futtathatja.
a következő típusú UniProt azonosítók támogatottak:
| P00750 | UniProtKB entry |
| P00750-2 | UniProtKB entry isoform sequence |
| P00750 | Part of UniProtKB entry sequence, from its 1st to 20th amino acid residue (inclusive) |
| A4_HUMAN | UniProtKB entry name |
| UPI0000000001 | UniParc entry |
| UniRef100_P00750 | UniRef entry |
If you válassza ki az eszköztár’ robbanás ‘ fülét egy UniProtKB, UniRef vagy UniParc belépési oldalról, az aktuális sorrend előre kitöltésre kerül az űrlapon.a
feladatok egyedi azonosítókkal rendelkeznek, amelyek (a feladat típusától függően) felhasználhatók lekérdezésekben (például két szekvencia hasonlósági keresés metszéspontjának lekérésére). A munkaazonosítókat és a kapcsolódó adatokat hét napig megőrizzük, majd töröljük.
opcionális beállítások
A Blast keresés opcionális beállításainak listája megtalálható a Súgóban.